科研产出
木薯耐旱基因CAT的生物信息学预测与分析
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用在线提供的生物信息学软件及Pathway Studio软件,以木薯(Manihot esculenta)过氧化氢酶(CAT)为研究对象,与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯10种植物CAT的氨基酸序列进行比较分析,揭示CAT氨基酸结构与耐旱特性的相关性。结果显示,木薯CAT1全长为1782 bp,包含一条长1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,通过同源性比对发现木薯CAT氨基酸序列与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯的同源性分别为82%、92%、81%、84%、80%、80%、79%、78%、78%、80%。木薯与麻风树同源性达到最高,为92%,最低是水稻和甘薯,为78%。木薯及其它10种植物CAT氨基酸序列的共同点为:没有导肽,不存在信号肽,为亲水性蛋白,无规则卷曲是最大量的结构元件,β-转角是最小的结构元件。此外,对跨膜结构域进行预测,木薯及其它10种植物均不存在跨膜结构域,但木薯CAT1整条肽链都位于膜内,其它10种植物的CAT均在膜外。CAT通过生物调节互作网络,在水杨酸(SA)、SOS及脱落酸(ABA)等的多重作用下,调节植物过氧化氢(H2O2)含量,提高植物抵抗逆境的能力。
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巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Hog1同源基因的克隆和序列分析
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：为了解MAPK信号途径中hog1基因在多主棒孢病菌(Corynespora cassiicola)侵染橡胶树过程中的作用,根据几种丝状真菌的hog1基因设计简并引物,采用PCR和RT-PCR的方法扩增巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌CC01的hog1基因,并对其扩增产物进行测序,同时还对该基因编码的蛋白进行氨基酸序列比对和系统发育分析。结果表明:该基因开放阅读框架为915 bp,编码304个氨基酸残基,包含6个内含子;该基因的氨基酸序列与小麦黄斑叶枯病菌(Pyrenophora tritici)MAPK HOG1(XP_001935555.1)、谷子弯孢病菌(Cochliobolus lunatus)MAP kinase ClK1(AFJ42499.1)等高度同源。
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不同新品系天然生胶加工性能分析
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用橡胶加工分析仪RPA2000,对目前海南、云南、广东三大植胶垦区中拟大规模推广种植的7个不同新品系天然生胶的加工性能进行分析,指标包括胶料的稠度及流变指数、粘弹特性、应力松弛时间、耐老化性能等。结果表明,云研77-2和热垦7-33-97生胶加工性能好,利于混炼加工;云研77-2及云研77-4的塑性保持率较小,耐老化性能差;湛试93-114的塑性保持率最大,耐老化性能最优。
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