科研产出
尖镰孢古巴专化型1号生理小种致病相关基因敲除突变体△Focr1-328的生物学特性
《菌物学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：由尖镰孢古巴专化型1号生理小种Fusarium oxysporumf.sp.cubenserace1(Focr1)引起的香蕉枯萎病是粉蕉类香蕉品种(AAB)不能规模化种植的最主要因素,其致病机理至今尚不十分清楚。本实验室前期通过T-DNA插入获得Focr1致病性丧失突变体Focr1-328,从Focr1全基因组序列中定位了因T-DNA插入失活的基因,并从野生型菌株Focr1-N2中敲除了该致病相关基因,获得了敲除突变体△Focr1-328。为了明确该致病相关基因的生物学功能,通过活体叶片、活体根部、孢子悬浮液等接种方法对敲除突变体△Focr1-328的致病性进行了测定,研究了该突变体与野生型菌株Focr1-N2在PDA培养基上菌落、菌丝和分生孢子形态上的差异;在不同碳、氮源培养基上的生长速率及形态差异;在培养不同时间后菌体生物量、pH值、OD值的变化差异及玻璃纸穿透能力的差异等。致病性测定结果显示4种接种方法都未见△Focr1-328发病症状,表明其丧失了致病力;表型测定结果显示:在PDA培养基上,△Focr1-328的生长速率、分生孢子产量、分生孢子萌发率、培养不同时间的菌丝干重均明显低于野生型菌株;在不同培养时间的培养液中,△Focr1-328的pH值、OD值均极显著低于野生型菌株Focr1-N2;敲除突变体和野生型菌株在不同碳、氮源上生长差异显著,最适碳源分别为山梨醇和麦芽糖,最适氮源均为硝酸钠;突变体菌株不能穿透玻璃纸生长,而野生型可以。上述实验结果表明:T-DNA插入失活的致病相关基因与菌株的碳源利用、产酸调控及菌丝穿透能力有关。
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油棕EST序列中SSR的分布特征分析
《中国油料作物学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为充分利用现有公共数据库中的EST资源开发EST-SSR引物,本研究从GenBank数据库获取39 227条油棕EST,通过聚类拼接和处理,得到全长为7 977.734 kb的无冗余序列15 716条。在这些序列中共检索出699个SSRs,检出率为4.45%,平均11.41 kb出现1个SSR,包括99种重复基元。其中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的类型,分别占总SSRs的38.48%和25.32%。在所有的核苷酸重复基序中,二核苷酸重复序列AG/CT所占比例最高,约占27.47%。Blastx分析发现44.95%的SSR-ESTs与非冗余蛋白质序列数据库(nr)中功能基因同源,功能已知的蛋白质中葡萄来源的SSR-ESTs所占比例最大,为4.42%。同时对54条SSR-ESTs通过GO体系进行功能分类,其中46条能找到同源物,其余8条无同源物,这些序列可划分为18个亚类,在所有功能亚类中,结合活性的功能项和SSR-ESTs数量最多,另外580条未被注释功能信息。
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简易高效油棕杂交方法研究
《广东农业科学 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为研发一种适用的油棕杂交授粉方法,根据油棕花序的特点,设计了两种花序杂交套袋(无纺布为材料,规格100～120 g,袋子顶端封口,底端开口,中间缝一拉链,拉链底部距袋子开口底端约25～30 cm)。花序开放5～7 d前进行套袋,在雄花序开放时收集花粉,过74μm筛;半开拉链,挤压花粉喷射器,从各方向均匀喷洒雌花序,然后拉上拉链。果穗分析结果表明,该法可实现高效控制授粉和获得较高结实率,其中套袋杂交授粉一次平均结实率达67.8%,授粉两次平均结实率达76.2%,均显著高于开放授粉下果穗结实率。
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森林生态系统养分动态模拟研究进展
《广东农业科学 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：养分循环是森林生态系统研究的重要内容。随着计算机技术与信息技术的广泛应用,数学模型、计算机模拟成为了森林生态系统养分循环的研究热点和重要的研究手段。综述了森林养分动态模拟研究进展,以期为今后森林生态系统数字化管理与指导生产提供理论参考。
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7种诱导剂诱导香蕉抗香蕉枯萎病初步研究
《广东农业科学 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：7种诱导剂诱导香蕉对香蕉枯萎病(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)的抗病性试验结果表明:诱导效果最好的是BTH,在浓度为200 mg/mL时达到了最好的44.27%;效果相对较差的是禾甲安,在浓度为100倍时仅为9.67%。碧护在20 000倍时达到最好防效27.86%,CTS在0.04 g/株时达到最好防效24.62%,好润在100倍时达到最好防效22.58%。
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蓖麻EST资源的SSR信息分析与功能注释
《热带作物学报 》 2012 CSCD
摘要：将NCBI公共数据库62 592条蓖麻EST序列进行拼接,得到无冗余Unigene 11 708条,总长度921 kb。在无冗余序列中发现含有SSR的EST序列2 471条,共3 271个位点。SSR发生频率为27.94%,平均分布距离为2.81 kb。在1～6 bp的重复基元中,单核苷酸重复基元出现频率最高(37.51%),其次是三核苷酸重复基元(34.63%)、二核苷酸重复基元(25.61%)。出现较多的重复基元是A/T(36.32%),其次是AG/CT(18.28%)。蓖麻的EST-SSR出现频率较高、类型较丰富、多态性潜能较高,具有较高的利用价值。对蓖麻的EST-SSR功能注释(COG,SwissProt,KEGG),有9条序列注释到脂肪酸合成与代谢相关的基因,为后续有针对性开发EST-SSR标记提供重要依据,也为进一步开发蓖麻EST-SSR标记奠定基础。
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5个自主培育橡胶树无性系适应性初探
《热带作物学报 》 2012 CSCD
摘要：为筛选橡胶树自育优良新品种,以5个自主培育无性系为研究材料,结合历年的风、寒害调查资料,对无性系的生长、乳管分化和抗性等性状展开系统的早期鉴定,结果表明:热试87-1和热试87-4整体表现良好,生长较快,乳管分化能力优于对照,抗风性、抗寒性较好,需要重点关注。热试87-5抗逆性突出,但乳管分化能力较弱;热试93-5和热试87-6生长较快,乳管分化能力强,但抗风性和抗寒性表现较差。因橡胶树较长的生长周期及我国多变的植胶区环境类型,上述结论尚需进一步验证。
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减施氮肥对稻田土壤剖面养分分布特征的影响
《热带作物学报 》 2012 CSCD
摘要：为探讨减施氮肥对养分在剖面垂直的分布与迁移的影响,采用大田试验,探讨了减施氮肥对稻田剖面养分累积和分布的影响。结果表明:3个处理下土壤剖面养分累积的趋势是:有机质、全氮、全磷、碱解氮、速效磷含量随土层深度的增加而降低,而全钾及速效钾含量则随土层深度的增加而提高。T3(80%的习惯施氮量)处理中除耕层的有效氮、速效磷及速效钾含量较T2(习惯施氮量)处理降低外,土壤其它各层有机质、全氮、全磷、全钾、有效氮、速效磷以及速效钾含量均较T2处理有所增加。T3处理有机质的增加主要集中在0～60 cm土层中,氮素主要集中在0～40 cm土层中,钾素则主要集中在0～20 cm土层中,土壤中各层的磷素在两个施肥处理中无显著差异,说明T3处理增加的养分主要集中在作物能吸收的范围内,这意味着对土壤培肥和作物生产更有利。
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木薯磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因全长cDNA克隆及表达分析
《热带亚热带植物学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：应用巢式PCR从木薯栽培种(Manihot esculenta)Arg7和野生种W14(M.esculenta subsp.flabellifolia)叶片中克隆到磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因pepc全长cDNA,GenBank序列号为JN387052和JN387053。cDNA全长2945 bp,含1个2895 bp的开放阅读框,预测编码的蛋白含964个氨基酸,具有磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶保守结构域。木薯PEPC与麻疯树和蓖麻的PEPC氨基酸序列具有高度同源性。表达分析表明pepc在W14和Arg7叶中的表达量最高,其次是须根和块根,茎中最低。单日表达量动态分析表明,Arg7叶中pepc总体表达量高于W14,但是16∶00后W14高于Arg7,推测两种木薯pepc调控区域存在差异。
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系谱和聚类分析在橡胶树内珠被组织培养中应用研究
《热带作物学报 》 2012 CSCD
摘要：分析16种不同基因型橡胶树幼果内珠被愈伤组织诱导率、分化率;追踪参试基因型系谱;并基于25对EST-SSRs分子标记数据对其进行聚类分析,研究系谱、聚类结果与体胚发生的关系。结果表明:16种基因型的愈伤诱导率均较高,位于68.46%～100%,7个基因型愈伤组织能诱导出体细胞胚状体,其中3个基因型能够较大量诱导体细胞胚状体,其余9个基因型的愈伤组织完全不具备分化能力;具有RRIM600亲缘的基因型体胚分化能力强,具有IAN873、PB5/51、热研217亲缘的基因型体胚分化能力弱或无体胚分化能力;16种基因型的相似系数位于0.56～0.89间,在遗传距离0.73时分为5类。体胚发生结果与系谱分析结果基本吻合,与聚类分析结果吻合度不大;提示可以利用系谱分析提高橡胶树组织培养的培养基筛选效率。最后讨论分子标记应用于组织培养的研究思路。
关键词： 巴西橡胶树 愈伤诱导 体细胞胚发生 基因型 系谱分析 聚类分析 SSR
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