鸡热休克蛋白70基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 晁哲
作者: 晁哲;林哲敏;刘海隆;张星;郑心力;黄丽丽;谢亮;王峰
作者机构:
关键词: 鸡;热休克蛋白70基因;多态性;生物信息学分析
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2014 年 41 卷 03 期
页码: 194-199
收录情况: 北大核心
摘要: 试验旨在克隆鸡热休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因,获得基因序列并分析基因结构和相关遗传变异,检测单核苷酸多态性(SNP)位点在文昌鸡和北京油鸡群体中的分布。试验利用PCR扩增鸡HSP70基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点。在鸡HSP70基因组中共发现3处突变位点,分别位于启动子区(T-564C)、5′非翻译区(A-68G)和编码区(A-1044G)。使用PCR-RFLP方法检测T-564C位点后发现,等位基因C在文昌鸡和北京油鸡中的基因频率分别为0.87和0.55。利用生物信息学分析发现,鸡HSP70基因启动子区域存在一些潜在的转录因子结合位点,如Sp1、AP-1、GATA-1、CREB、MZF1和HSF2等。
分类号: Q78`S831
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