基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 纪薇

作者： 纪薇;焦晓博;罗尧幸;赵伟;郭雯岩;刘榕晨;赵旗峰;马小河

作者机构：

关键词： 葡萄;RNA-Seq;新转录本预测;基因结构优化

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2019 年 05 期

页码： 617-628

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 由于葡萄(Vitis spp.)基因组注释的不完善,本文以3个生长时期3种性状葡萄花器官(雌能花、雄花和两性花)为材料提取总RNA进行高通量测序,开展了葡萄新转录本发掘和已注释基因结构优化工作。获得173.41Gb高质量的过滤后的数据(clean data),发掘出839个新转录本,其中697个新转录本得到了注释信息,同时对10 163个已注释基因的结构进行了优化。本研究旨在为后续葡萄基因组学、表型研究和其他生物基因组注释信息的完善提供参考。

分类号： S663.1

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