鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 常玉梅

作者： 常玉梅;高国强;徐丽华;刘金亮;刘春雷;梁利群

作者机构：

关键词： 鲤鱼;表达序列标签;耐低温;相关分析;连锁图谱

期刊名称： 动物学研究

ISSN： 0254-5853

年卷期： 2010 年 31 卷 06 期

页码： 20-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用GLM模型对12个表达序列标签(expressed sequence tag,EST)标记的基因型与鲤耐低温性状进行相关性分析,然后使用OneMap软件将这些EST标记进行连锁定位研究,并通过Blast x搜索引擎对这些候选EST进行注释。结果显示,EST标记CC009(P<0.05)和CC115(P<0.01)与鲤鱼耐低温性状显著相关;12个EST标记中有8个标记分别连锁定位到6个连锁群中,其中与耐低温相关的CC009和CC115分别定位到鲤连锁图谱的第38号连锁群和第2号连锁群;蛋白质数据库同源性比对发现,CC009与斑马鱼(Danio rerio)尿嘧啶激酶1(uridine-cytidine kinaseI)的同源性高达94%;而CC115为原绿球藻(Prochlorococcus marinus str)的假定糖基转移酶(putative glycosyl transferase)的同源性为56%。

分类号： S917.4`Q953

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