光诱导香菇菌丝转色阶段的转录因子表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 唐利华

作者： 唐利华;鲍大鹏;万佳宁;李燕;王莹;谭琦

作者机构：

关键词： 香菇;转色;光线;转录因子;高通量测序

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2016 年 35 卷 09 期

页码： 1106-1116

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 转录因子在真菌环境响应及生理过程中发挥重要的调节作用。本文利用转录组测序(RNA-Seq)技术研究光诱导香菇菌丝转色过程中的转录因子表达变化。转录组测序结果表明,在光照条件下转色的菌丝(313C)与黑暗条件下未转色的菌丝(313W)相比,香菇菌丝中共有68个转录因子基因表达发生变化(48个转录因子上调表达,20个转录因子下调表达);转色的菌丝(313C)与初始未转色的菌丝(118)相比,香菇菌丝中有80个转录因子基因表达发生变化(49个转录因子上调表达,31个转录因子下调表达)。这些差异表达的转录因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族。另外,样品的两两比较中差异表达的转录因子既存在部分重叠,也表现特异性。其中,313C/313W中有14个特异性差异表达转录因子,313C/118中有26个特异差异表达的转录因子。重叠的转录因子有64个,其中有39个表达水平上调,15个表达水平下调。采用实时荧光定量PCR对几个转录因子进行了表达检测,其中部分转录因子的表达趋势与转录组分析基本相同。这些数据为进一步研究香菇转色的转录调控奠定了一定的基础。

分类号： S646.12

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