4个不同地理种群中华鳖POMC基因全长cDNA克隆及其序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张林

作者： 张林;邹世平;艾晓辉;吴涛

作者机构：

关键词： 中华鳖;不同地理种群;POMC基因;单核苷酸多态性;分子遗传标记

期刊名称： 华中农业大学学报

ISSN： 1000-2421

年卷期： 2012 年 31 卷 05 期

页码： 123-127

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨中华鳖不同地理种群的POMC基因的多态性,建立区分中华鳖不同地理种群的分子遗传标记,采用RT-PCR的方法扩增得到4个不同地理种群(太湖鳖种群、沙鳖种群、台湾鳖种群和黄河鳖种群)中华鳖的POMC基因,对该基因进行克隆及序列测定,并对所测序列进行比较,分析其SNP位点,并对所得的SNP位点进行验证。结果显示:4个不同地理种群中华鳖所扩增的POMC基因的核苷酸序列均为786bp;以megalign软件比较分析4个不同地理种群中华鳖的POMC基因,发现该序列中共有15个多态性核苷酸位点,经过验证,第129位核苷酸的变异为台湾鳖种群不同于其他种群的变异,第441位核苷酸变异为太湖鳖种群不同于其他种群的变异,第168和396位核苷酸为黄河鳖种群不同于其他种群的变异,第531和618位核苷酸为沙鳖种群不同于其他种群的变异。结果表明,中华鳖的POMC基因存在多态性,不同地理种群中华鳖POMC基因均有各自特异的核苷酸序列,可以作为区分中华鳖的不同地理种群的分子遗传标记。

分类号： S966.5

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