花生FAT基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张会

作者： 张会;单雷;李新国;郭峰;孟静静;万书波;彭振英

作者机构：

关键词： 花生;酰基载体蛋白硫酯酶(FAT);可变剪接;表达模式

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 19-26

摘要： 酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase,FAT)是控制植物种子油脂合成的关键酶,根据其氨基酸序列和底物特异性不同可分为FATA和FATB两类。为了更深入了解花生FAT(Ah FAT)的特点与功能,本研究对Ah FAT家族基因进行了全基因组生物信息学分析。在花生基因组中共有20个FAT基因,不均匀分布在2个基因组的12条染色体上。20个Ah FATs可以分为Ah FATA和Ah FATB两个亚家族,Ah FATA亚家族有2个基因,Ah FATB亚家族有18个基因。Ah FATA家族基因具有6或8个外显子,Ah FATB家族基因结构较为复杂,外显子数目5~8个;Ah FATs都不具有跨膜结构域但是都具有保守的Acyl-ACP_TE结构域。对Ah FAT家族基因进行可变剪接分析,发现只有少数发生了可变剪接,且具有组织特异性。对Ah FATs表达模式分析的结果显示,Ah FATAs和Ah FATBs都在种子发育后期表达量较高。

分类号： Q943.2`S565.2

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