文献类型： 中文期刊
第一作者： 秦桢
作者： 秦桢;李吉涛;李明栋;王佳佳;葛倩倩;刘萍;李健
作者机构：
关键词： 脊尾白虾;盐碱水环境;DNA甲基化;差异表达基因
期刊名称： 渔业科学进展
ISSN： 2095-9869
年卷期： 2022 年 43 卷 004 期
页码： 33-50
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为探讨盐碱水环境对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)基因组DNA甲基化的影响,本研究利用MethylRAD-Seq技术探究了长期盐碱水养殖组(SAS)和正常海水养殖对照组(SW)脊尾白虾鳃组织中的DNA甲基化水平,并对关键通路和基因进行了差异表达分析.结果显示,脊尾白虾鳃组织基因组中CG和CWG位点(W=A或T)分别检测到2 347 003和416 176处甲基化,甲基化普遍存在于基因组的基因间区和内含子区域,共筛选到8805个(8189个CG-DMSs和616个CWG-DMSs)差异甲基化位点,盐碱水环境下DNA甲基化水平略有增强.通过KEGG富集分析发现,DMS所在差异表达基因显著富集在HIF-1信号通路和剪接体通路,通路中hif-p、hk和sf3b1等关键基因在脊尾白虾盐碱水环境适应中可能发挥着重要作用;对SW和SAS组差异甲基化基因(DMG)进行筛选,得到158个CG-DMGs和94个CWG-DMGs,其中,富集到脂质代谢和囊泡介导的转运通路中的DMG最多;此外,有一些DNA甲基化位点与基因表达呈负相关,表明DNA甲基化与基因调控之间存在复杂的联系,大部分基因组DNA甲基化对基因表达有正调控效应.本研究结果首次分析了在盐碱水环境下脊尾白虾鳃组织的DNA甲基化水平特征,为解析甲壳类盐碱水环境适应机制提供了基础信息.
分类号： S917.4
- 相关文献
[1]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020
[2]水稻幼苗期低温胁迫DNA甲基化特征分析. 郭慧,李树杏,甘雨,张宏伟,郝留根,杨占烈,向关伦. 2023
[3]汞胁迫下脊尾白虾线粒体基因组拷贝数变化特征分析. 张培,李志辉,赵莲,薛蓓,李明传,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2016
[4]脊尾白虾MSTN基因组织及不同蜕皮后时间点的表达特征. 薛蓓,张培,李志辉,赵莲,邰小飞,徐晔,赖晓芳,高焕,阎斌伦. 2016
[5]脊尾白虾腺苷酸转移酶基因应答蜕皮的表达特征研究. 李硕,白玉,薛蓓,娄海华,杨秀航,董逸,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2017
[6]脊尾白虾线粒体基因组应答饥饿的甲基化特征分析. 高焕,赵莲,薛蓓,朱国华,赖晓芳,陈建华,申欣,阎斌伦. 2015
[7]脊尾白虾不同发育期线粒体基因组甲基化特征分析. 薛蓓,张培,李志辉,赵莲,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2017
[8]镉胁迫对脊尾白虾的毒性效应研究. 薛蓓,张培,李志辉,赵莲,赖晓芳,陈建华,高焕,阎斌伦. 2016
[9]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)组织蛋白酶D基因的克隆及其表达分析. 段亚飞,刘萍,李吉涛,李健,陈萍,高保全,徐文斐,王有昆. 2013
[10]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)维甲酸X受体基因克隆及其在温盐胁迫和蜕皮周期中的表达分析. 柳飞,李健,李吉涛,葛倩倩,连春盎,常志强. 2016
[11]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda) FAMeT基因在卵巢发育周期中的表达分析. 李志敏,李健,李吉涛,何玉英,葛倩倩,索帅. 2016
[12]脊尾白虾14-3-3基因cDNA全长的克隆和表达分析. 王有昆,刘萍,李吉涛,李健. 2016
[13]脊尾白虾抗细胞凋亡因子DAD1基因的克隆及其组织表达分析. 段亚飞,刘萍,李吉涛,李健,高保全,陈萍. 2014
[14]不同养殖密度对脊尾白虾生长和水体氨氮含量的影响. 李志辉,马杭柯,张培,徐莞媛,孙金秋,阎斌伦,张庆起,高焕. 2018
[15]碳酸盐碱度对脊尾白虾生存、生长、繁殖及免疫酶活性的影响. 柳飞,李健,李吉涛,葛倩倩,葛红星,沈明明. 2016
[16]脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析. 孙金秋,徐莞媛,马杭柯,高威,欧阳乐飞,高焕,阎斌伦. 2020
[17]海洋酸化对脊尾白虾抗氧化酶活性的影响. 李晨辉,王梦杰,彭艳青,高焕,王怀忠,王海华,陈建华. 2018
[18]温度和盐度对脊尾白虾生长和非特异性免疫的影响. 李志辉,王玉,李光光,朱佶轩,阎斌伦,张庆起,高焕. 2019
[19]脊尾白虾不同发育期mtDNA拷贝数变化特征分析. 张培,徐莞媛,李志辉,高焕,张庆起,赖晓芳,陈建华,阎斌伦. 2018
[20]脊尾白虾对低氧响应的转录组学分析. 曹梅,王兴强,秦传新,沈晔,张子杨,钱诗悦. 2021
作者其他论文 更多>>
-
砜吡草唑与嗪草酮复配应用于大豆-玉米带状复合种植田的效果评价
作者：高兴祥;冯克;张国福;杨素梅;李美;李健;金岩;张耀中
关键词：砜吡草唑;嗪草酮;联合作用类型;大豆-玉米带状复合种植;防除效果;安全性
-
广适性玉米新品种中研1603的选育及栽培技术
作者：王小博;常晓;刘柏林;杨兆生;李健
关键词：玉米;中研1603;选育;栽培技术
-
甘肃某羊场免疫布鲁菌病疫苗后绵羊流产原因的调查及分析
作者：刘志杰;刘萍;吴锦艳;尚佑军;何继军;王子坚;蔡江;聂帅帅;李鹏飞;杜国玉;苟惠天;曹小安
关键词：布鲁菌病;Q热;流产;rpoB基因
-
彩色棉品种金垦棕11号选育及栽培技术要点
作者：李吉莲;马麒;宁新柱;徐守振;陈红;刘萍;谢斌;刘齐峰;林海
关键词：彩色棉;金垦棕11号;品种选育;优质;抗病;栽培技术
-
基于响应面法优化双酶同步酶解的全豌豆乳的稳定性及营养特性研究
作者：肖丹虹;李萍;邓媛元;刘光;赵志浩;王佳佳;钟立煌;廖娜;张名位
关键词：全豌豆乳;响应面法;双酶同步酶解;稳定性;消化特性
-
梯棱羊肚菌杂交子代单孢菌株在新品种选育中的应用
作者：宋彩云;刘萍;李仔密;马渊浩;柴红梅;赵永昌
关键词：羊肚菌;杂交;子囊孢子;育种;农艺性状
-
长期碳酸盐碱度胁迫对脊尾白虾生长及卵巢发育的影响
作者：张秀红;李吉涛;王佳佳;王成伟;秦桢;葛倩倩;刘萍;李健
关键词：脊尾白虾;碳酸盐碱度胁迫;生长;组织切片;酶活性;卵巢发育
