毛白杨BABY BOOM基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨紫彤

作者： 杨紫彤;姜廷波;魏建华;丁莉萍

作者机构：

关键词： 毛白杨;BBM基因;克隆;生物信息学

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2021 年 011 期

页码： 2155-2166

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： BBM （BABY BOOM）转录因子是植物细胞全能性和胚胎发生的关键调控因子。利用PCR技术从毛白杨‘BJHR01’幼叶cDNA中克隆得到PtoBBM1和PtoBBM2基因,利用生物信息学软件,对这两个基因的序列和功能进行分析。结果表明:毛白杨中PtoBBM1蛋白与毛果杨中PtrBBM1 （B9HHX9）蛋白相似性高达96%; PtoBBM2与PtrBBM2 （B9HYI0）蛋白相似性达到98%。此外, PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均含有2个AP2保守结构域,三级结构预测它们均和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。理化性质分析推测PtoBBM1和PtoBBM2均是不稳定的亲水蛋白,不具有信号肽,亚细胞定位预测PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均定位于细胞核,都具有跨膜结构。进化树分析显示,杨树BBM与蓖麻、棉花BBM归为一个分支,亲缘关系较近。组织表达分析表明, PtoBBM1主要在根中表达,叶和茎中表达量较低; PtoBBM2主要在叶和根中表达,茎中表达量较低, 2个同源基因表达具有组织部位的差异性。在胚性愈伤组织形成过程中,PtoBBM1和PtoBBM2基因均在胚性愈伤组织形成期表达量最高,说明PtoBBM1和PtoBBM2基因可能在杨树胚性愈伤组织形成中发挥作用。

分类号： S792.117

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