产黑普雷沃氏菌糖基转移酶基因的扩增和序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 余乃通
作者: 余乃通;罗志文;龚殿;王健华;刘志昕
作者机构:
关键词: 产黑普雷沃氏菌;糖基转移酶基因;PCR扩增;序列分析
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2016 年 35 卷 01 期
页码: 107-112
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 产黑普雷沃氏菌(Prevotella melaninogenica)属革兰阴性专性厌氧菌,是引起牙周疾病的病原之一。为了研究牙周炎患者产黑普雷沃氏菌是否存在及其分子特征,用棉签刮取患者口腔,沸水-液氮法破碎细胞,同时设计产黑普雷沃氏菌糖基转移酶基因的1对引物,利用常规PCR方法扩增产黑普雷沃氏菌糖基转移酶基因。经NCBI序列相似性比对,发现该患者感染的产黑普雷沃氏菌糖基转移酶基因核苷酸序列与P.melaninogenica ATCC 25845菌株的糖基转移酶基因(Gen Bank accession No.CP002122)同源性最高,达92%;其编码的糖基转移酶部分氨基酸序列与P.melaninogenica菌株的甘露糖糖基转移酶(Gen Bank accession No.WP_013264679)同源性最高,达98%。以糖基转移酶部分氨基酸序列构建系统进化树,结果表明,本试验获得的产黑普雷沃氏菌与其它报道的P.melaninogenica菌株同源性最高,属于同一组(group)。
分类号: R781.42`Q78
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