基于非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的菜心SCoT分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史卫东

作者： 史卫东;罗海玲;康红卫;琚茜茜;张力

作者机构：

关键词： 菜心;抗虫性;非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳;SCoT分析

期刊名称： 亚热带植物科学

ISSN： 1009-7791

年卷期： 2020 年 49 卷 01 期

页码： 1-8

摘要： 以菜心(Brassica rapa var. parachinensis)抗小菜蛾品种Caixin65和感小菜蛾品种Caixin69及6份F2株系为材料,利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测菜心抗虫株系的SCoT多态性,同时进行SCoT多态性的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测效率、遗传多样性分析和差异条带克隆分析。结果表明,非变性聚丙烯酰胺凝胶能检测出亲本与子代间的SCoT多态性和遗传多样性变化,条带数量较多且清晰,提高了SCoT标记检测效率。选取亲本的10条非变性聚丙烯酰胺凝胶差异片段克隆测序,获得感虫序列4条、抗虫序列6条,GENSCAN预测其中8条具有启动子、终止子、阅读框等基因结构序列。同源性检索分析表明,感虫序列分别与泛素羧基末端水解酶mRNA序列、大白菜克隆序列、白菜线粒体丙酮酸载体蛋白序列、甘蓝基因组编码未知蛋白的HDEM序列同源,抗虫序列分别与白菜RNA假尿苷合酶4线粒体mRNA序列、京水菜线粒体DNA序列、白菜未知蛋白mRNA序列、白菜4-香豆酸:辅酶A连接酶mRNA序列、大白菜克隆序列、哈茨木霉mRNA序列同源。本研究提高了SCoT标记清晰度、遗传多样性检测水平和差异片段克隆的精准性,使得SCoT成为批量克隆差异片段的高效工具,有助于挖掘SCoT功能性标记信息,开展初步的功能基因组学研究,提高优异株系筛选鉴定效率,加快育种进程,为菜心抗虫性机制的进一步研究提供理论基础。

分类号： S634.5

  • 相关文献

[1]菜心抗虫性的cDNA-AFLP分析. 康红卫,史卫东,罗海玲,周建辉,踞茜茜,张力,农贵雄. 2018

[2]国内外苜蓿种质起始密码子遗传多样性分析. 王健胜,侯桂玲,程立平,谢永凤. 2016

[3]~(60)Co-γ辐射对木薯生长的影响及其突变体的SCoT分析. 谢向誉,尚小红,周慧文,陆柳英,曾文丹,曹升,赖大欣,严华兵. 2018

[4]高粱微卫星非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳条件的优化. 许丽,李玥莹,邹剑秋,林凤,许昕,陶思源. 2007

[5]虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、溪红点鲑(Salvelinus fontinalus)及杂交种(虹鳟♀×溪红点鲑♂)血清蛋白多态性的研究. 张立颖,赵萌,李文通,袁丁,杨贵强. 2013

[6]几种鲑鳟鱼血清蛋白非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的研究. 杨贵强,徐绍刚,王建,高云奇,王占全. 2013

[7]虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、溪红点鲑(Salvelinus fontinalus)及杂交种(虹鳟♀*溪红点鲑♂)血清蛋白多态性的研究. 张立颖,赵萌,李文通,袁丁,杨贵强. 2013

[8]鉴定水稻品种的微卫星标记筛选. 施勇烽,应杰政,王磊,朱智伟,庄杰云. 2005

[9]木薯SSR标记非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳条件的优化. 吉家敏,夏志强,邹枚伶,王文泉. 2009

[10]蓖麻蚕血液胰凝乳蛋白酶抑制剂种类的调查. 赵秀振,赵巧玲,唐顺明,沈兴家,徐安英,张国政,郭锡杰. 2007

[11]甜菜SSR扩增产物不同检测方法的比较研究. 邹奕,刘乃新,马龙彪,吴则东,李红侠. 2018

[12]三种CRISPR/Cas9基因敲除变异检测方法的比较分析. 唐国盘,黄安群,孙志鹏,匡友谊,王胜杰,王大伟. 2019

[13]2012年秋季菜心品比试验初报. 佘旭东,刘凤军,牟建梅,徐君,李军,张国芹,宋英,何玲珍. 2013

[14]钾肥类型对菜心(菜薹)生长、细胞保护酶和内源激素的影响. 黄旺平,康云艳,杨暹,赵普艳,张晓艳,叶珺琳,李仕芳. 2015

[15]绿宝70天菜心细胞核不育系转育研究. 秦进华,赵建锋,孙玉东,朱明超,刘友华. 2008

[16]早熟菜心种质夏秋季的表型性状. 佘旭东,刘凤军,徐君,李军,牟建梅,张国芹,徐遥. 2014

[17]菜心细胞质雄性不育系转育研究. 唐文武,周军,吴秀兰. 2010

[18]黄曲条跳甲为害引起的菜心价值损失及防治指标研究. 宋艳霞,董易之,张茂新. 2011

[19]抑制小白菜、菜心硝酸盐积累的栽培技术研究. 李群,潘大丰,陕方,周向阳,张兵,金肇熙,王多加,钟娇娥. 2005

[20]采收期和播种量对菜心经济产量和外观品质的影响. 佘旭东,刘凤军,牟建梅,宋英,张国勤,徐君,李军. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序