辽宁乡土杨树重测序遗传进化全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蔄胜军

作者： 蔄胜军;冯连荣;刘巍;尹杰;林晓峰;倪鹏跃;安云全

作者机构：

关键词： 乡土杨树;遗传进化;全基因组关联分析

期刊名称： 辽宁林业科技

ISSN： 1001-1714

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 1-7,40

摘要： 为揭示辽宁省乡土杨树遗传进化和多样性,该文对辽宁省主要乡土杨树14个样品进行重测序,开展了遗传进化全基因组关联分析和数据评估.本次分析数据量为75.57 Gbp的Clean Data,Q30达到 93.77%.测序数据质量质控以及与参考基因组对比统计结果显示:与参考基因组平均比对率为96.72%,基因组覆盖深度为84.92%(至少一个碱基覆盖),平均覆盖深度为10X.通过样品的SNP和InDel的检测和注释,进行了遗传进化和遗传多样性分析,并对乡土杨树群体进行了评价.从系统发育变异检测结果看,白杨派发育早,与黑杨派、青杨派在系统发育中亲缘关系较远,青杨派种间有基因交流现象.该项研究为乡土杨树资源保护和利用提供参考.

分类号： S792.11

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