江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任春梅

作者： 任春梅;程兆榜;缪倩;魏利辉;周益军;范永坚

作者机构：

关键词： 西瓜花叶病毒;葫芦科作物;cp基因;序列分析;江苏

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2013 年 44 卷 09 期

页码： 1464-1470

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】对江苏各地具典型褪绿花叶症状的多种葫芦科作物是否为西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)侵染进行分子鉴定,明确该病毒在江苏的遗传分化。【方法】提取样品总RNA,利用西瓜花叶病毒的cp基因特异性引物进行RT-PCR扩增,克隆测序,应用DNASTAR和Clustal X软件进行序列分析。【结果】来自南瓜、瓠瓜、西瓜和西葫芦的11个分离物的RNA模板中均检测到1200 bp左右的片段;序列测定表明该片段含1154个核苷酸,包含完整的编码281个氨基酸的WMV-cp基因。序列比对结果表明,11个分离物和来自不同地区的17个分离物WMV-cp基因核苷酸和推导的编码CP蛋白氨基酸序列同源性分别为90.5%~100.0%和92.9%~100.0%。【结论】WMV的遗传变异与地缘相关性较强而与寄主相关性较弱。江苏分离物WMV-CP氨基酸均具有蚜传株系的特征结构域DAG,暗示其田间流行与蚜虫有关。

分类号： S432.41

  • 相关文献

[1]5种病毒侵染葫芦科作物的症状观察. 彭斌,顾青,古勤生,刘丽锋,李莉. 2004

[2]西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析. 何丹,海利力·库尔班,玉山江·麦麦提,李继阳,杨渡,韩盛. 2015

[3]小西葫芦花叶病毒(ZYMV)安徽合肥分离物的鉴定. 李世访,范卫红,成卓敏,王杰. 2003

[4]节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA-ITS序列分析与系统进化研究. 赵芹,谢大森,何晓明,陈仁芳,彭庆务,罗少波. 2014

[5]苹果茎沟病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆和序列分析. 郑银英,洪霓,王国平,胡红菊. 2006

[6]青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析. 程亮. 2019

[7]河北省藁城花生病毒病的 RT-PCR 检测及外壳蛋白基因序列分析. 康彦平,晏立英,雷永,廖伯寿. 2015

[8]苹果茎痘病毒PCR检测及分子变异分析(摘要). 李丽丽,董雅凤,张志宏,张尊平,裴光前. 2009

[9]部分蔬菜CMV分离物CP基因的克隆及序列分析. 陈伟,罗静,庄木,李艳红,冯兰香,王晓武,谢丙炎,刘玉梅,方智远. 2006

[10]芝麻黄花叶病病原的分子鉴定. 晏立英,许泽永,廖伯寿. 2009

[11]30个马铃薯卷叶病毒CP基因序列分析. 韩树鑫,张俊华,白艳菊,张威,高艳玲,范国权,张抒,申宇. 2016

[12]海南胡椒中黄瓜花叶病毒分离物的分子鉴定. 牛立霞,王健华,冯团诚,刘志昕. 2008

[13]河北省藁城花生病毒病的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析. 康彦平,晏立英,雷永,廖伯寿. 2015

[14]侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析. 牛立霞,牛胜鸟,王健华,刘志昕. 2008

[15]花生条纹病毒(红安分离物)cp基因的克隆和序列分析. 晏立英,许泽永,陈坤荣. 2007

[16]2016年江苏省类猪圆环病毒P1分子流行病学回顾性调查. 盛少阳,温立斌,茅爱华,朱雪姣,李彬,任子利,何孔旺. 2019

[17]利用RT-PCR检测黄瓜上的西瓜花叶病毒. 王惠哲,李淑菊,霍振荣,庞金安,张桂霞. 2004

[18]西瓜花叶病毒和小西葫芦黄花叶病毒复合侵染南瓜的透射电镜诊断. 宋西娇,陈浙,何步远,李艳敏,王荣洲,吴建祥,洪健. 2015

[19]新疆吐鲁番地区三种甜瓜病毒病的发生与分子鉴定. 韩盛,韩成贵,玉山江·麦麦提,杨军,杨渡. 2016

[20]瓜蚜在西葫芦植株上传播获取西瓜花叶病毒的效率及西瓜花叶病毒病的发生规律. 毛晓红,刘国霞,张秀霞,李娇娇,张安盛. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序