基于转录组测序的姬松茸镉胁迫下内参基因筛选

文献类型: 中文期刊

第一作者: 黄在兴

作者: 黄在兴;陈华;翁伯琦;刘斌;王义祥;刘朋虎

作者机构:

关键词: 巴西蘑菇;镉胁迫;不同组织;荧光定量PCR

期刊名称: 微生物学报

ISSN: 0001-6209

年卷期: 2021 年 61 卷 011 期

页码: 3458-3470

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]筛选不同实验条件下,尤其是镉胁迫下的姬松茸内参基因,为研究姬松茸镉富集相关基因功能研究奠定基础.[方法]根据不同浓度Cd(0、2、5 mg/L)胁迫下菌丝中转录组表达量数据,筛选出18个候选基因,设计了30对引物;根据引物扩增的特异性、扩增效率初步筛选出来自不同基因的5对引物;运用qRT-PCR检测了5个基因在不同浓度Cd胁迫下的菌丝样品、原基、菌柄和菌盖中的Ct值,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper对这些基因的表达稳定性进行评价.[结果]SGT2和STK是菌丝阶段Cd胁迫下最稳定的2个候选内参基因,GAPDH是不同组织中最稳定的内参基因,SGT2、STK和GAPDH是所有实验条件下最稳定的3个内参基因.[结论]在姬松茸镉胁迫条件下,本研究筛选出的SGT2和STK比常用的内参基因表现出更强的稳定性.

分类号: X173`S646

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