棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵亮

作者： 赵亮;狄佳春;陈旭升

作者机构：

关键词： 棉花;甲基转移酶;SABATH;基因家族;次生代谢

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2018 年 17 期

页码： 38-42

收录情况： 北大核心

摘要： 甲基化作用广泛存在于生物体内,在许多生物进程中发挥着关键的修饰作用,包括基因和代谢的调控。甲基化由甲基转移酶(methyltransferases,简称MTs)依赖S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosine-L-methionine,简称SAM)作为甲基供体催化形成相对应的甲基化形式产物。SABATH甲基转移酶家族在最初发现鉴定的3个酶的基础上共同命名为SABATH甲基转移酶(SABATH-MTs)。这3个酶分别是水杨酸羧基甲基转移酶(salicylic acid carboxyl methyltransferases,简称SAMT)、苯甲酸羧基甲基转移酶(benzoic acid carboxyl methyltransferases,简称BAMT)和可可碱合酶(theobromine synthase)。为探究该基因家族在棉花基因组中的分布情况,本研究利用生物信息学方法在四倍体陆地棉、二倍体A基因组亚洲棉和二倍体D基因组雷蒙德氏棉中分别预测到37、24、22个基因成员;能够与已知功能的SABATH-MTs成员聚集于同一分支分别为17、8、9个基因成员。在预测到的四倍体陆地棉37个基因成员中,能够在转录组数据库中查找到表达的有20个基因。

分类号： S562

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