茶树TIDH核苷酸多样性及与咖啡碱含量的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周晨阳

作者： 周晨阳;金基强;马春雷;姚明哲;陈亮

作者机构：

关键词： 茶树;咖啡碱;次黄嘌呤核苷酸脱氢酶;TIDH;基因克隆;关联分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 005 期

页码： 981-988

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 咖啡碱是嘌呤碱中最重要的一种,对茶叶的滋味等品质起重要的作用,对于咖啡碱代谢途径的研究有重要意义.根据NCBI登录的TIDH基因(编码咖啡碱合成途径的一个关键酶-次黄嘌呤核苷酸脱氢酶)cDNA设计引物,克隆获得了一条基因组DNA的中间片段,长4172bp(TIDH3).从中国茶树资源核心种质中选取咖啡碱含量有代表性的95份资源进行了两个年度、春秋两季的咖啡碱含量HPLC测定,大部分材料的咖啡碱含量在2.50%~4.50%,4次重复的平均值为3.50%,变异系数在15.52%~19.25%,表明茶叶咖啡碱含量在不同年份与季节都是相对稳定的.经PCR扩增、测序和序列多态性分析,TIDH3中的一个759bp片段的总核苷酸多样性指数πT和θW分别为0.006和0.012,同义突变多样性πsyn=0.009大于非同义突变多样性πnonsyn=0.006.Ka/Ks=0.600<1,认为TIDH3基因受到负向选择作用.TIDH3基因连锁不平衡分析表明,基因内的连锁不平衡衰减速度较快,在约300bp范围内r2值降低到了0.2.通过关联分析,获得两个与咖啡碱含量显著相关的SNP位点,遗传贡献率分别为10.43%和5.68%.

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]基于转录组挖掘蕉城苦茶苦茶碱合成相关基因. 陈潇敏,王鹏杰,王淑燕,杨如兴,孙君,郭永春,陈雪津,赵峰,叶乃兴. 2021

[2]高咖啡碱茶树品种生物学性状及生化品质特征研究. 李家贤,黄华林,何玉媚,晏嫦妤,卓敏. 2010

[3]植物中的咖啡碱:从合成途径研究到转基因作物. 孔祥瑞,杨军,王让剑. 2012

[4]咖啡碱生物合成有关的N-甲基转移酶研究进展及其在低咖啡碱茶树育种中的应用前景. 姚明哲,周晨阳,金基强,马春雷,陈亮. 2010

[5]不同黄化茶树种质中咖啡碱合成部位的研究. 张亚真,钟思彤,陈志辉,孔祥瑞,单睿阳,郑士琴,余文权,陈常颂. 2024

[6]茶树咖啡碱代谢及低咖啡碱茶树育种研究进展. 吴华玲,陈栋,李家贤. 2011

[7]茶树咖啡碱合成相关基因研究及利用进展. 刘振,杨阳. 2009

[8]利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性. 姚明哲,乔婷婷,马春雷,金基强,陈亮,杨亚军. 2009

[9]单核苷酸多态性在茶树中应用的研究进展. 陈丝,郭燕,杨春,李燕. 2018

[10]EST-SSR标记与茶树表型性状关联的初步分析. 姚明哲,乔婷婷,马春雷,金基强,陈亮. 2010

[11]植物关联分析的研究进展及其在茶树分子标记辅助育种上的应用前景. 乔婷婷,姚明哲,周炎花,马春雷,王新超,陈亮,杨亚军. 2009

[12]中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析. 史晓丽,张莹雪,孟宪红,孔杰,栾生,罗坤,曹宝祥,曹家旺,陈宝龙. 2019

[13]次黄嘌呤核苷酸脱氢酶对猪链球菌2型GN061215生物学特性及蛋白质表达的影响. 周俊明,何孔旺,倪艳秀,张雪寒,杨志彪,祝昊丹,温立斌,俞正玉,茅爱华,吕立新. 2013

[14]猪链球菌2型IMPDH基因功能结构域的研究. 刘亚彬,何孔旺,倪艳秀,周俊明,张雪寒,陆承平. 2009

[15]茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析. 陈林波,李叶云,王琴,高永亮,江昌俊. 2010

[16]茶树CCoAOMT基因克隆及启动子的结构分析. 林海燕,罗勇,陈丝,禹双双,曾泽媛,刘仲华,王坤波,黄建安. 2019

[17]茶树查尔酮异构酶基因克隆及序列分析. 马春雷,赵丽萍,张亚丽,陈亮. 2007

[18]茶树叶绿素合成相关基因克隆及在白叶1号不同白化阶段的表达分析. 马春雷,姚明哲,王新超,金基强,马建强,陈亮. 2015

[19]茶树无色花色素还原酶基因克隆及表达分析. 马春雷,乔小燕,陈亮. 2010

[20]茶树叶片黄化变异相关的CAB基因家族鉴定及关键基因挖掘. 钟思彤,张亚真,游小妹,陈志辉,孔祥瑞,林郑和,伍慧妮,金珊,陈常颂. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序