利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张媛

作者： 张媛;胡则辉;周志刚;陈亚瞿

作者机构：

关键词： 刀鲚;遗传多样性;遗传变异;RAPD-PCR;ISSR-PCR;AMOVA

期刊名称： 上海水产大学学报

ISSN： 1004-7271

年卷期： 2006 年 15 卷 04 期

页码： 390-397

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用RAPD-PCR及ISSR-PCR两种分子标记技术对长江出海口两年3个群体的52条刀鲚(Coiliaectenes)进行群体遗传结构的分析。在3个群体中,利用RAPD-PCR标记技术,15个10 bp随机引物共检测到110条带,多态性为0.490~0.657,Shannon多样性指数为18.63~22.38,Nei平均遗传距离为0.1195~0.1454;而利用11个ISSR引物所获得的相应结果分别为67、0.576~0.682、11.56~13.66以及0.117~0.147。相关性分析表明这两种技术所获得的上述数据呈正相关(r=0.95,P<0.05)。AMOVA结果显示,3个群体按采集时间划分成的两年之间的遗传变异不超过总变异的1.1%,同一年内群体间的遗传变异也分别只占总变异的6.99%(RAPD-PCR)和2.75%(ISSR-PCR),群体内各个体之间的遗传变异占总变异的96%(P<0.0001),说明两年内所采集的3个群体之间基本上没有产生遗传分化。基于样品之间的Nei遗传距离所构建的Neighbor-joining聚类图也清楚地显示出没有按采样的时间产生群体的遗传分化。对各样品之间的Nei遗传距离及Neighbor-joining聚类图分别经Mantel检测及支序分析,发现ISSR-PCR技术所获得的结果与RAPD-PCR技术的结果不存在明显的正相关,但ISSR-PCR标记技术具有在待测样品中能检测到高多态性等优点。

分类号： S917.4

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