斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龚明

作者： 龚明;李燕;鲍大鹏;尚俊军;杨瑞恒;周陈力;万佳宁;吴莹莹

作者机构：

关键词： 斑玉蕈;遗传变异;生长速率;SNP;GWAS

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 18-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以38份斑玉蕈（Hypsizygus marmoreus）种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP（single nucleotide polymorphism）数据,结合在不同温度（10、15、20、25、30℃）下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析（genome wide association study, GWAS）。结果表明:供试群体分为4大类群;在实验范围内,20、25℃为斑玉蕈适宜生长温度;GWAS分析显示20、25℃分别存在10、14个与生长速率显著关联的SNP位点,其中1个属于潜在功能性SNP位点。

分类号： S646

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