桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张杰伟

作者： 张杰伟;吴婷;任飞;谢华;魏建华

作者机构：

关键词： 钙调磷酸酶B类似蛋白;桃;基因家族;进化分析;序列特征

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2017 年 30 卷 03 期

页码： 511-516

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用。利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域。进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族。TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区。PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3和5均含有1个N-豆蔻酰化位点。NetPhos 2.0 Server结果显示PpCBLs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CBL的功能提供重要的理论基础。

分类号： S662.1

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