菜豆花色全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 卢甜甜

作者： 卢甜甜;刘志远;徐兆生;张合龙;李国亮;折红兵;钱伟

作者机构：

关键词： 菜豆;全基因组关联分析;花色;表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年 49 卷 002 期

页码： 332-340

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以124份菜豆为试验材料,分别在2019年和2020年调查花色表型,利用全基因组关联分析(GWAS)的方法对调控花色的基因进行挖掘.结果 表明:2年间供试菜豆花色表型基本一致,仅有1份材料存在差异.对124份菜豆材料进行重测序共获得517.58 Gb的数据量(10×),通过与菜豆参考基因组比对,获得5130030个SNP,过滤后得到3701584个SNP.利用这些高质量的SNP基于压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)将菜豆花色调控基因定位在6号染色体322.67 kb的区域内;在候选区域内共鉴定到8个基因,其中,Phvul.006G020200为参与花青素调控的MYB转录因子基因,且在不同花色材料中差异性表达,为调控菜豆花色的关键候选基因.

分类号： S643.1

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