藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 时丕彪

作者： 时丕彪;王德领;蒋润枝;李斌;晏军;方迪;闫凯旋;顾闽峰

作者机构：

关键词： 藜麦;锌指同源异型结构域（ZF-HD）;全基因组;盐胁迫;基因表达;

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2022 年 002 期

页码： 304-312

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以藜麦的高质量基因组为参考，对藜麦锌指同源异型结构域（ZF-HD）转录因子基因CqZF-HD进行全基因组鉴定，并利用生物信息学方法对其编码的蛋白质理化性质、二级结构、亚细胞定位、保守结构域以及基因结构、系统进化关系进行了分析。同时，利用前期转录组测序结果分析了CqZF-HD家族基因在盐胁迫下的表达模式。结果表明，在藜麦中共鉴定出21个ZF-HD转录因子，大部分定位在细胞质，二级结构以无规则卷曲为主，氨基酸序列长度68～284 aa,相对分子质量7.54×10~3～30.20×10~3,理论等电点6.01～9.54;每个ZF-HD蛋白都含有ZF或HD保守结构域，系统进化树将其划分为5个亚家族。盐处理下表达分析结果显示，11个CqZF-HD基因响应藜麦盐胁迫，其中8个基因呈上调表达，3个基因呈下调表达，说明ZF-HD家族基因在参与藜麦盐胁迫中发挥着不同的作用。

分类号： S519

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