马铃薯X病毒黑龙江分离物外壳蛋白基因克隆与序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张威
作者: 张威;白艳菊;申宇;高艳玲;范国权;耿宏伟;王魏;孟宪欣
作者机构:
关键词: 马铃薯X病毒;外壳蛋白;核苷酸;序列分析;亲缘关系
期刊名称: 黑龙江农业科学
ISSN: 1002-2767
年卷期: 2010 年 08 期
页码: 1-5
收录情况: CSCD
摘要: 马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)是重要的马铃薯病毒之一,几乎分布于全国所有马铃薯种植区域,严重影响马铃薯的产量和品质。对其建立RT-PCR分子检测体系以及对其外壳蛋白(CP)基因进行序列分析尤为重要。根据已报道的PVX的核苷酸序列设计合成1对引物,以带毒植株总RNA为模板,应用RT-PCR方法,克隆了PVX黑龙江分离物(P2)全长CP基因序列。序列分析表明:P2CP基因全长711 bp,编码237个氨基酸残基,与GenBank中17个不同分离物的CP核苷酸序列同源性为75.5%~96.3%,氨基酸序列同源性为89.4%~99.2%。依据PVXCP氨基酸序列建立系统进化树,将PVX不同分离物划分为两大类群,P2与PVX中国分离物亲缘关系较近,同属于类型Ⅱ,表现一定的地域相关性。同时,应用该RT-PCR分子检测体系进行马铃薯样品检测。
分类号: S435.32
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