黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李颖

作者： 李颖;谢占玲;田飞;贾贤卿;方慧;夏明哲

作者机构：

关键词： 黄绿蜜环菌;SSR-PCR;体系优化;正交设计;引物

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2013 年 16 期

页码： 114-119

收录情况： 北大核心

摘要： 以CTAB法提取的黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens)DNA为模板,应用L16(45)正交实验设计,对Mg2+、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶、模板浓度5种因素进行SSR-PCR反应体系优化,建立了适合黄绿蜜环菌SSR-PCR反应的最佳体系并对退火温度进行检测。结果表明:在15μL反应体系中包括:1×PCR Buffer,100ng模板DNA,dNTPs 217μmol/L,引物0.5μmol/L,Taq DNA聚合酶0.75U,Mg2+1.3mmol/L。稳定性检测证明,该反应体系具有较高的稳定性和重复性,并从34对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物8对。该体系的建立为今后利用SSR标记对黄绿蜜环菌遗传多样性研究、亲缘关系分析及种质资源鉴定等研究提供了依据。

分类号： S567.39

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