胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 齐燕妮
作者: 齐燕妮;李闻娟;王利民;赵玮;党照;谢亚萍;张建平
作者机构:
关键词: 胡麻;SUC基因家族;基因结构分析;系统进化分析
期刊名称: 甘肃农业科技
ISSN: 1001-1463
年卷期: 2019 年 08 期
页码: 35-40
摘要: 利用多个物种的SUC基因蛋白序列在胡麻基因组内进行BlastP分析,通过Pfam确认结构域,获得胡麻SUC基因家族成员,并进行基因结构分析;对蛋白分子量、等电点、信号肽、跨膜结构域、糖基化修饰位点、亚细胞定位、Motif及二级结构进行预测。结果鉴定得到12个胡麻SUC基因家族成员,大部分成员含有4个以上的外显子,10个以上跨膜结构域,并获4个特征性Motif。进化树分析显示,胡麻SUC分别属于SUT1、SUT2和SUT4家族。
分类号: S565.9
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