胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 齐燕妮

作者: 齐燕妮;李闻娟;王利民;赵玮;党照;谢亚萍;张建平

作者机构:

关键词: 胡麻;SUC基因家族;基因结构分析;系统进化分析

期刊名称: 甘肃农业科技

ISSN: 1001-1463

年卷期: 2019 年 08 期

页码: 35-40

摘要: 利用多个物种的SUC基因蛋白序列在胡麻基因组内进行BlastP分析,通过Pfam确认结构域,获得胡麻SUC基因家族成员,并进行基因结构分析;对蛋白分子量、等电点、信号肽、跨膜结构域、糖基化修饰位点、亚细胞定位、Motif及二级结构进行预测。结果鉴定得到12个胡麻SUC基因家族成员,大部分成员含有4个以上的外显子,10个以上跨膜结构域,并获4个特征性Motif。进化树分析显示,胡麻SUC分别属于SUT1、SUT2和SUT4家族。

分类号: S565.9

  • 相关文献

[1]芸薹属AC基因组中SUC基因家族的鉴定与进化分析. 袁午舟,周荣芳,童超波,程晓晖,黄军艳,于景印,董彩华,刘胜毅. 2014

[2]大麻GRAS转录因子家族的全基因组鉴定及镉胁迫下表达分析. 尹明,杨大为,唐慧娟,潘根,李德芳,赵立宁,黄思齐. 2021

[3]花生膜联蛋白基因家族成员的结构和表达分析. 王慧敏,李新国,万书波,张智猛,丁红,李国卫,高文伟,彭振英. 2019

[4]甘蓝型油菜生物素羧基载体蛋白基因的克隆与结构分析. 戴晓峰,卢长明,吴刚,武玉花,肖玲. 2007

[5]△12-脂肪酸脱氢酶及其编码基因研究进展. 刘永红,张丽静,张洪荣,傅华. 2011

[6]绵羊附红细胞体部分16S rRNA基因序列测定和系统进化分析. 何立雄,黄新,杨华,张云峰,郑金海,周建国,徐雪平,钟发刚. 2009

[7]果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位. 魏潇,刘威生,刘宁,章秋平,张玉萍,刘硕,刘有春. 2011

[8]小麦TaSnRK2.9蛋白激酶基因克隆与生物信息学分析. 连魏卫,唐益苗,高世庆,张朝,赵昌平. 2011

[9]雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析. 张毓婷,王敏华,陈家栋,戎均康,丁明全. 2014

[10]长穗偃麦草EeDREB2基因的克隆与生物信息学分析. 孙珊珊,杨涛,柳珊,陈京瑞,赵昌平,唐益苗,高世庆. 2013

[11]柑橘黄龙病病原菌的鉴定及16S rDNA序列分析. 孙大光,郑雪芳,刘波,阮传清,夏育陆,段永平. 2011

[12]高粱基因组DCL家族的系统进化与表达分析. 张腾,尹梦娇,郭红媛,姜晓东,贾举庆,王艳胜,温贺,梁月秀,赵立松,赵威军,吕晋慧,李艳锋,张春来. 2019

[13]亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析. 齐燕妮,李闻娟,王利民,赵玮,党照,谢亚萍,张建平. 2019

[14]基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析. 钟裕俊,杜素洁,潘立婷,王玉生,王福莲,刘万学. 2020

[15]菜粉蝶Pain离子通道基因的克隆和功能研究. 毛芬,张晓宇,黄佳,叶恭银. 2020

[16]江苏葫芦科作物上瓜类褪绿黄化病毒的发生及其分离物全基因组序列分析. 杨柳,任春梅,陆芳,缪倩,程兆榜,季英华. 2024

[17]MIC5基因在13株不同基因型的刚地弓形虫中的序列变异(英文). 刘文阁,徐晓佩,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015

[18]海南豇豆枯萎病病原鉴定及生物学特性初步研究. 肖敏,曾向萍,严婉荣,吉训聪,王会芳,赵志祥. 2015

[19]StGID1基因调控马铃薯植株高度、直径和叶绿素含量. 李华鹏,彭小荷,梁晓,唐铭霞,王克秀,胡建军. 2024

[20]黄瓜绿斑驳花叶病毒基因组全序列分析及病害的田间调查. 肖彩利,郑红英,吴晓花,李国景,燕飞,陈剑平. 2016

作者其他论文 更多>>