山羊草SPL转录因子基因家族分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨紫贻
作者: 杨紫贻;米福贵;唐芳;高翠萍;伊风艳
作者机构: 内蒙古农业大学草原与资源环境学院/草地资源教育部重点实验室;内蒙古自治区农牧业科学院
关键词: 山羊草;SPL基因家族;转录因子;基因家族分析
期刊名称: 中国草地学报
ISSN: 1673-5021
年卷期: 2021 年 010 期
页码: 9-17
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 基于生物信息学方法,从山羊草全基因组中鉴定出18个AetSPL基因,定位于7条染色体。系统发育分析显示,山羊草AetSPLs基因可分为5个组,与小麦的进化关系最为接近。基因结构和基因的保守序列分析发现,山羊草SPL基因家族具有相对保守的基因结构和功能结构域,基因的启动子顺式作用元件主要与光响应、生长素反应和胁迫应答有关。miR156靶位点预测显示,AetSPL3、AetSPL5、AetSPL7、AetSPL8、AetSPL10、AetSPL12、AetSPL14和AetSPL16中具有miR156的识别位点,可能是miR156的靶基因。
分类号: S544.9
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