野巴旦杏AlsCBF基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李宁

作者： 李宁;李疆;刘立强;罗淑萍

作者机构：

关键词： 野巴旦杏;Als CBF;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2015 年 31 卷 32 期

页码： 54-61

收录情况： CSCD

摘要： 对克隆获得的野巴旦杏基因Als CBF进行生物信息学分析,从而为该基因的功能鉴定提供理论基础,以期为新疆巴旦杏的抗寒育种提供基因来源。通过采用RT-PCR和RACE方法从野巴旦杏中克隆到植物抗逆途径关键转录因子CBF基因全长并命名为Als CBF,Gen Bank登录号为HQ908653。生物信息学分析表明:该基因全长1171 bp,其中编码区长714 bp,编码237个氨基酸,其蛋白的分子式为C1156H1832N332O356S15,相对分子质量为26.5581 k Da,理论等电点为6.76,该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。肽链可能含有8处丝氨酸磷酸化位点,1处苏氨酸磷酸化位点。三维结构预测表明其符合AP2结构域模型特点。本研究通过对Als CBF基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗寒过程中有重要的作用。

分类号： S662.9

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