大豆gma-miR1508a靶基因预测及功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李永光

作者： 李永光;艾佳;王涛;金龙国;邱丽娟;李文滨

作者机构：

关键词： 大豆;miRNA;启动子;靶基因

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2014 年 33 卷 04 期

页码： 19-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： microRNA(miRNA)是生物中广泛分布的、内源性的、由21~25个核苷酸大小的非编码单链小分子RNA。miRNA与靶基因mRNA具有互补关系,能够介导降解靶基因和转录后水平的基因沉默,引起目的基因表达的下调。通过利用PlantCARE、PMRD、BAR等数据库对gma-miR1508a启动子顺式调控元件和靶基因进行了生物信息学分析,启动子分析结果表明gma-miR1508a含有多种非生物胁迫响应元件,其表达受ABA、低温、干旱等胁迫诱导。利用PMRD软件预测获得7个gma-miR1508a的靶基因,分别参与了细胞凋亡、开花调控、逆境胁迫、细胞壁修饰等调控,最终通过拟南芥同源基因分析获得了Glyma10g03840.1、Glyma16g27800.1、Glyma17g07280.1等5个与低温反应相关的候选靶基因。

分类号： S565.1

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