樱桃番茄Cf9基因调控元件预测及同源基因系统发育分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘子记

作者: 刘子记;刘维侠;牛玉;杨衍

作者机构:

关键词: 启动子;表达调控;同源基因;同源指数;基因进化

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 13-17+25

收录情况: 北大核心

摘要: 为探明Cf9基因的表达调控元件和同源基因进化关系,从樱桃番茄品种京番红星中克隆了Cf9上游序列,利用PlantCARE启动子预测工具对转录起始位点上游1 500 bp序列进行顺式调控元件分析。结果表明,Cf9启动子不仅含有TATA-box和CAAT-box等核心元件,而且含有光响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、水杨酸响应元件等。Cf9基因可能受光、水杨酸和茉莉酸甲酯等诱导表达。Cf9同源基因系统进化分析结果表明,当同源指数为0.65时,番茄、马铃薯、辣椒、烟草中含有Cf9同源基因,同源基因既包括旁系同源基因,也包括直系同源基因,分析结果也进一步说明番茄与马铃薯的亲缘关系最近,其次为辣椒、烟草。

分类号: S641.2

  • 相关文献

[1]番茄Mi-1基因调控元件及同源基因进化分析. 刘子记,刘维侠,牛玉,杨衍. 2020

[2]家蚕滞育关联山梨醇脱氢酶基因的启动子活性分析. 朱娟,谢雨辰,陈艳荣,唐顺明,易咏竹,沈兴家. 2018

[3]茶树己糖激酶基因CsHXK2的启动子克隆及表达特性分析. 李娜娜,刘莹,张豪杰,王璐,郝心愿,张伟富,王玉春,熊飞,杨亚军,王新超. 2020

[4]湖北海棠5A基因进化与表达分析. 罗昌国,乔玉山,张计育,薛华柏,高志红,渠慎春,章镇. 2011

[5]植物WRKY转录因子家族GroupⅡa基因研究进展. 罗昌国,袁启凤,裴晓红,吴亚维,郑伟,章镇. 2015

[6]微生物砷甲基化及挥发研究进展. 王培培,陈松灿,朱永官,孙国新. 2018

[7]甘薯近缘种三浅裂野牵牛核基因组密码子分析. 秦桢,侯夫云,张安,李爱贤,董顺旭,王庆美. 2019

[8]菠萝PEPC基因家族生物信息学分析. 马海洋,赵秋芳,陈曙,石伟琦,冼皑敏. 2020

[9]马传染性贫血病毒LTR在驴胎皮肤细胞中的基因进化及启动子活性比较. 全滟平,沈楠,郭巍,赵立平,周建华,沈荣显,相文华. 2008

[10]西瓜防御素(ClPDF)基因挖掘及序列分析. 张曼,羊杏平,徐锦华,刘广,姚协丰,李苹芳. 2013

[11]大豆Nramp基因家族的序列特征与亲缘关系分析. 胡润芳,林国强,张广庆,滕振勇,陈志雄. 2011

[12]鸭梨GAPDH基因家族的克隆及其表达特征. 闫洪波,葛文雅,程玉豆,何近刚,关军锋. 2012

[13]蒺藜苜蓿花器官特异基因的表达分析. 马利超,王彦荣,刘志鹏. 2012

[14]不同植物Mlo基因全基因组鉴定及系统进化分析. 史建磊,万红建,熊自立,张海利,马彦如,苏世闻,宰文珊. 2020

[15]水稻Pi9位点6个稻瘟病抗性基因特异分子标记的开发及应用. 杨好,黄衍焱,易春霖,石军,谭楮湉,任文芮,王文明. 2023

[16]葡萄成花分子生物学研究进展. 丰景,卢江. 2018

[17]大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析. 宿洋,杨静,郭勇,杜维俊,邱丽娟. 2021

[18]绵羊脑多头蚴病45m基因在多头绦虫和细粒棘球绦虫不同发育阶段同源性的比较. 由弘,张壮志,赵莉,石保新,吐尔洪·依米提,王进成,张文宝,崔德胜,艾尔肯,郭金梁. 2009

[19]雄蕊瓣化形成机制研究进展. 欧景莉,黄雪梅,胡艺帆,韦壮敏,杨贵兵,陈豪军,何江,马松琼,范競升,彭东海. 2023

[20]甘蓝型油菜每角果粒数全基因组关联分析. 肖小军,陈明,韩德鹏,余跑兰,郑伟,肖国滨,周庆红,周会汶. 2023

作者其他论文 更多>>