拮抗菌与病原菌碳水化合物酶类比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 柳少燕

作者： 柳少燕;陈捷胤;李蕾;戴小枫

作者机构：

关键词： 生物防治;拮抗菌;病原菌;细胞壁降解酶;基因家族扩增

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2013 年 32 卷 01 期

页码： 105-112

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 拮抗菌通过分泌细胞壁降解酶降解病原菌细胞壁组分是其重要的拮抗方式。本研究以2个拮抗菌(绿色木霉和枯草芽孢杆菌)和7个植物病原菌为研究对象,对碳水化合物酶类CAZymes(Carbohydrate-active enzymes)进行了注释和比较分析,明确了拮抗菌相对于病原菌发生扩增的细胞壁降解酶亚家族;利用ClustalX2.0多序列比对、Mega4.0构建系统发育树和MEME软件预测保守基序的方法,分析了扩增亚家族的序列结构和进化特征。结果表明,拮抗菌中可能参与病原菌细胞壁降解酶类的亚家族CBM50、GH25和GH73发生了显著扩增,并通过序列比较和进化分析初步明确了扩增的亚家族与拮抗菌特异降解病原菌细胞壁组分之间存在关联,为拮抗菌细胞壁降解酶类亚家族CBM50、GH25和GH73参与拮抗的分子机理提供理论依据。

分类号： S476

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