基于线粒体COI基因的3种草蛉的系统发育关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡红岩

作者： 胡红岩;张职显;卢珍华;任相亮;马小艳;马亚杰;宋贤鹏;马艳

作者机构：

关键词： 草蛉;线粒体COI基因;DNA条形码;遗传距离;系统发育树

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 937-943

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】基于线粒体COI基因片段测序及分析,研究3种草蛉的系统发育关系,探讨DNA条形码准确鉴定草蛉种类的可行性。【方法】利用PCR扩增和测序技术,获得来自不同地区的12个样本3种草蛉的COI基因片段序列。运用DNAMAN软件对序列进行拼接比对,并从GeneBank数据库中下载9种草蛉的COI序列,利用MEGA 7.0软件对23条序列进行碱基序列分析、遗传距离分析及系统发育分析。【结果】序列保守位点469个,变异信息位点188个,简约信息位点150个,自裔位点38个。序列中A、T、G和C的含量分别为28.6%、41.1%、15.4%和14.9%;A+T含量（69.7%）高于G+C含量（30.3%）,呈现出明显的A+T碱基偏好。草蛉种内遗传距离为0～0.005,种间遗传距离为0.022～0.184。在系统发育树（最大似然法/邻接法）中,同一属的物种以较高的置信度聚类在一起。【结论】基于COI基因片段的DNA条形码技术可以用于草蛉的分类鉴定。

分类号： S476.2

  • 相关文献

[1]DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用. 万方浩,张爱兵,闵亮,张桂芬. 2012

[2]国际生命条形码计划—DNABarcoding. 程佳月,王丽华,彭克美,张宁波,唐中林,杨述林,李奎. 2009

[3]国际生命条形码计划—DNA Barcoding. 程佳月,王丽华,彭克美,张宁波,唐中林,杨述林,李奎. 2009

[4]面包果DNA条形码筛选与遗传多样性分析. 高效梅,伍宝朵,胡丽松,谭乐和,吴刚. 2023

[5]DNA条形码技术在小花蝽属昆虫分类鉴定中的应用. 胡泽章,孙猛,吕兵,段敏,翟一凡,陈浩,郑礼,于毅. 2017

[6]栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析. 俞立璇,刘美艳,曹清河,余益成,谢逸萍,罗永海,韩永华,李宗芸. 2014

[7]胡枝子属种质材料的种子蛋白图谱研究. 王照兰,杜建材,史万光,胡卉芳,武玉山. 2013

[8]基于DNA条形码技术对镰刀菌属的检测鉴定. 雷娅红,况卫刚,郑春生,李秀璋,高文娜,李春杰. 2016

[9]不同植物DNA条形码对铁皮石斛鉴定能力的评价. 陈文强,汪小福,陈笑芸,彭城,徐俊锋,蔡健. 2021

[10]南极鱼亚目鱼类DNA条形码及分子系统学. 姜郦轩,张吉昌,樊钢洲,李昂,柳淑芳,庄志猛. 2021

[11]DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用. 李献儒,柳淑芳,李达,杜腾飞,庄志猛. 2015

[12]DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性. 王开杰,徐永江,柳学周,崔爱君,姜燕,王滨,方璐. 2022

[13]基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定. 田虎,张金良,张桂芬,陈苗苗,万方浩. 2014

[14]中国东北地区亚洲玉米螟遗传多样性及寄主专化性分析. 王克勤,刘兴龙,邵天玉. 2018

[15]基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析. 钟裕俊,杜素洁,潘立婷,王玉生,王福莲,刘万学. 2020

[16]基于DNA条码基因的鳢科鱼类系统进化与物种鉴定. 赵建,梁宏伟,孙博,李伟,朱新平,叶朝阳,上官清,陈昆慈. 2018

[17]DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定与溯源研究中的应用. 万方浩,张桂芬. 2016

[18]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2008

[19]基于DNA序列的12种粉蚧亲缘关系分析. 何衍彪,万宣伍,詹儒林,孙光明,刘映红,许再福,赵艳龙. 2011

[20]DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定与溯源研究中的应用. 万方浩,张桂芬. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序