黑龙江野鲤核糖体内转录间隔区1(ITS-1)的克隆及二级结构的预测与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 钟立强

作者： 钟立强;张成锋;蔡生力;刘红;李冰;朱健

作者机构：

关键词： 黑龙江野鲤;内转录间隔区1(ITS-1);基因克隆;二级结构

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2010 年 26 卷 04 期

页码： 112-117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黑龙江野鲤是中国北方重要的养殖鱼类,分析和了解其遗传结构对鲤鱼种质资源的保护和遗传性状的改良具有重要的意义。该研究对黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)核糖体内转录间隔区1(ITS-1)进行了克隆测序,并对ITS-1序列进行了分析。结果显示:所克隆的黑龙江野鲤ITS-1序列长度为365 bp,其中A、T、G、C 4种碱基的含量分别为21.4%、12.3%、34.0%和32.3%;与从GenBank中检索到的6种鲤科鱼类的ITS-1序列相比较,相似性较低,介于24.9%至59.5%之间;同时利用最小自由能原理预测7种鲤科鱼类ITS-1序列的二级结构,并分析了其结构特点。根据鲤鱼与其他6种鲤科鱼类的ITS-1序列的同源性构建NJ系统进化树,与根据该保守序列形成的发夹结构的相似性构建的进化树大致相同,所得的分类结果与传统的分类结果基本一致。因此,一、二级结构相结合将是研究物种分子系统学的重要手段。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]四个鲤鱼种群ITS-1序列的遗传变异分析. 钟立强,张成锋,周凯,李冰,王建新,朱健. 2011

[2]建鲤和黑龙江野鲤杂交与自交F_1代肌肉营养成分的比较. 张成锋,李冰,钟立强,王建新,朱健. 2010

[3]黑龙江野鲤(Cyprinus haematopteru)与建鲤(Cyprinus carpio var.Jian)正反交与自交子代消化酶活力及其分布比较分析. 李冰,张成锋,王建新,谢婷婷,朱健. 2011

[4]黑龙江野鲤细菌人工染色体基因组文库构建. 耿波,关云涛,孙效文. 2009

[5]用RAPD方法研究草鱼、柏氏鲤和3个地理种群鲤的亲缘关系. 邹曙明,楼允东,孙效文,沈俊宝. 2000

[6]黑龙江野鲤、散鳞镜鲤良种选育技术. 刘明华,沈俊宝,张铁齐. 1992

[7]黑龙江野鲤和建鲤正反交与自交子代血液学指标比较. 李冰,张成锋,朱健,钟立强,王建新. 2009

[8]黑龙江野鲤肌肉营养成分分析. 尹洪滨,马波. 1999

[9]建鲤和黑龙江野鲤自交以及正反交子代生长比较. 朱健,柴学森,李冰,张成锋. 2014

[10]建鲤和黑龙江野鲤自交和正反交F_1形态差异分析. 李冰,柴学森,张成锋,朱健. 2014

[11]中国鲤几个代表种群基因组DNA遗传多样性分析. 常玉梅,孙效文,梁利群. 2004

[12]水温变化对黑龙江野鲤繁殖的影响. 尹家胜,邱岭泉,徐伟,崔喜顺,周长海. 2002

[13]斑马鱼SSLP标记检测鲤鱼种间的遗传多态性. 孙效文,梁利群. 2001

[14]金黄色葡萄球菌新型耐热核酸酶(Nuc2)的定点突变与特性分析. 陈丽敏,施春雷,王大鹏,张道锋,史贤明. 2015

[15]类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然. 2009

[16]兔病毒性出血症病毒基因组3′端非编码区的分子克隆及生物信息学分析. 刘光清,张玉颖,云涛,倪征,张淼涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜青云,盛祖恬. 2006

[17]猪圆环病毒Ⅱ型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测. 刘光清,倪征,云涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜清云. 2005

[18]漂洗和斩拌对海鲈鱼肌球蛋白理化特性的影响. 林婉玲,刘芳芳,李来好,吴燕燕,杨少玲,黄卉,杨贤庆,林织. 2020

[19]马丙酮酸脱氢酶激酶4基因序列生物信息学分析. 陈建兴,马芷妍,刘永斌,刘娟,董彦飞,孙玉江. 2019

[20]海鲈鱼糜加工及凝胶形成过程中蛋白质的变化机理. 刘芳芳,林婉玲,李来好,吴燕燕,杨少玲,黄卉,杨贤庆,林织. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序