甘肃地区一株PCV-3流行毒株的全基因序列测定及遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张辉

作者： 张辉;马雪青;袁红;李勇生;魏达礼;卢曾军;刘在新;韩庆彦;孙普

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒3型;流行毒株;全基因组;遗传变异;基因缺失

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN：

年卷期： 2023 年 013 期

页码： 80-87,93

收录情况： 北大核心

摘要： 为了了解甘肃地区猪圆环病毒（PCV）的基因特征，试验采用PCR方法和基因测序技术，对甘肃省2018—2022年期间发生流行性腹泻的死亡仔猪病料进行回顾性检测，并对获得的毒株进行全基因测序，同时与参考毒株序列进行基因特征分析。结果表明：试验成功获得一株PCV-3毒株，将其命名为GSJN/2/2018毒株，该毒株的全基因组序列长度为1 999 nt,在1 149 nt处缺失碱基G,与参考毒株全基因序列的核苷酸相似性为97.8%～99.8%;ORF1和ORF2基因与参考毒株的核苷酸和氨基酸序列相似性分别为98.8%～99.9%/97.0%～100%和96.4%～99.7%/94.4%～100%;基于全基因组序列、ORF1和ORF2基因序列分别构建的系统进化树均将GSJN/2/2018毒株划分为PCV-3a基因型；该毒株主要线性抗原表位和3个滚环复制基序FTINN、HLQG、YCKK没有发生变异。说明通过回顾性检测获得的甘肃地区流行较早的GSJN/2/2018毒株属于PCV-3a基因型，并发现了新的基因缺失，丰富了PCV-3的基因组信息。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]猪流行性腹泻病毒变异毒株的分离鉴定及遗传演化分析. 辛忠昊,郭效珍,逯晓寒,焦安琪,刘丽萍,于江,黄兵,孙淑红,吴家强. 2022

[2]我国部分地区猪圆环病毒2型流行毒株的遗传变异分析. 郭龙军,陆月华,危艳武,黄立平,刘长明. 2009

[3]我国部分地区猪圆环病毒2型分离株的遗传变异分析. 郭龙军,陆月华,危艳武,黄立平,刘长明. 2009

[4]一株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列的遗传变异分析. 于博,章振华,姜北宇,钱爱东,李林,景小冬,张建伟. 2010

[5]猪圆环病毒2型山西分离株的遗传变异多样性分析. 吴忻,孟帆,姚敬明,樊振华,王娟萍,韩一超,米瑞娟,薛翼鹏,赵岳,刘文俊. 2017

[6]华南地区猪圆环病毒3型分子流行病学研究. 蒋智勇,蔡汝健,楚品品,林德锐,勾红潮,李艳,宋帅,李春玲. 2018

[7]一例猪圆环病毒3型与猪圆环病毒2型混合感染的实验室诊断. 杨克礼,焦祖武,田永祥,周丹娜,段正赢,郭锐. 2018

[8]猪圆环病毒2型和3型双重荧光PCR检测方法建立及应用. 翟少伦,娄亚坤,杜丽银,温肖会,翟颀,周秀蓉,贾春玲,霍玮,陈美霞,杨燕秋,吴国景,吕殿红. 2021

[9]猪圆环病毒3型PCR诊断方法的建立及初步应用. 姜玲玲,徐雨,余国富,魏赐开,唐远江,卢昱希,蒲龄,杨莉,余波. 2020

[10]猪圆环病毒3型去核定位信号的Cap蛋白原核表达. 陈如敬,吴学敏,陈秋勇,严山,车勇良,王晨燕,周伦江. 2020

[11]猪圆环病毒3型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立. 陈如敬,吴学敏,陈秋勇,车勇良,王隆柏,严山,周伦江. 2020

[12]猪圆环病毒3型TB GreenⅡ实时荧光定量PCR检测方法的建立和应用. 李鹏,孙延举,王寅彪,金前跃,梁晓晓,银梅,王选年,刘兴友,王利平. 2023

[13]回顾性研究证明中国猪圆环病毒3型存在不同进化分支. 郭雨欣,姜海军,王菁,侯磊,韦莉,刘爵. 2019

[14]猪圆环病毒3型和4型TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法的建立. 殷冬冬,王洁茹,尹磊,沈学怀,戴银,赵瑞宏,侯宏艳,胡晓苗,王桂军,潘孝成. 2023

[15]一例猪链球菌与猪圆环病毒3型混合感染的诊治. 蔡卫忠,吴早林,全涛,杨克礼,田永祥. 2022

[16]PCV3河南株Cap基因的克隆、测序及其在大肠杆菌中的表达. 郭奎,徐朋丽,赵宇,郑慧华,杨明凡,陈红英. 2018

[17]猪圆环病毒3型Cap蛋白的原核表达. 王帅勇,汪琪,朱世强,姚云,虞凌雪,刘晓敏,单同领,郑浩,周艳君,童武,李国新,高飞,童光志,于海. 2021

[18]山东省鸭类感染猪圆环病毒3型的初步调查. 刘玉伟,辛长勋,王硕,高梅,郑书轩,时建立,彭喆,吴晓燕,王金宝,李俊. 2018

[19]猪圆环病毒3型检测及其Cap结构序列和抗原性预测分析. 湛洋,王东亮,王乃东,蒋一凡,黄坤,崔尚金,姜平,杨毅. 2017

[20]福建省番鸭小鹅瘟流行毒株病原学研究. 林锋强,程晓霞,朱小丽,陈少莺,江丹丹. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序