脂肪酸去饱和酶FAD3蛋白特征及其在大豆中的遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李战

作者： 李战;王影;于莉莉;陈伊洁;于欢;王俊;邱丽娟

作者机构：

关键词： GmFAD3;α-亚麻酸;大豆;蛋白结构;单倍型分析

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2023 年 04 期

页码： 396-405

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微体ω-3脂肪酸去饱和酶(Fatty Acid Desaturase 3,FAD3)是植物种子α-亚麻酸生物合成的关键酶。尽管很多FAD3基因被分离和鉴定，植物FAD3蛋白结构特征及遗传演化研究较少。为了探究脂肪酸去饱和酶FAD3蛋白特征及其在大豆中的遗传演化情况，本研究分析了37个物种(包括33种植物、2种蓝藻和2种真菌)的51个FAD3蛋白的序列特征和进化关系，并分析了大豆3个GmFAD3(GmFAD3A、GmFAD3B和GmFAD3C)基因在598份材料中的单倍型及其编码蛋白构象。结果发现，植物FAD3蛋白序列和结构较为保守，其进化关系与植物分化进程一致。GmFAD3A、GmFAD3B和GmFAD3C分别包含14,4和4种单倍型。GmFAD3A-1(Hap1/2)在各大豆种植区域均有分布，Hap3/4/5除华南和西北地区外，其他地区均有分布。虽然GmFAD3A-1(Hap1/2/4)和GmFAD3A-1(Hap3/5)编码蛋白构象差异较大，但可能与地理分布并无关联。而GmFAD3A-2(Hap1～5)编码蛋白构象基本相同，表明GmFAD3A-2可能并未受到选择。GmFAD3B(Hap1/2/4)中地方品种占比较高，其中Hap1/2在我国各大豆主要产区均有分布，而Hap3中改良品种占比较高(78.57%),仅分布在东北、华北和华东地区，表明GmFAD3B(Hap1/2/4)和GmFAD3B(Hap3)编码蛋白构象差异可能受地理因素影响的同时受到人工选择。GmFAD3C中Hap1占比极高(98.66%),在我国各大豆种植区域均有分布，说明该基因比较保守，可能在大豆脂肪酸去饱和过程中起到非常重要的作用。本研究为GmFAD3在大豆α-亚麻酸积累中的作用机制解析和高α-亚麻酸育种提供参考。

分类号： S565.1

  • 相关文献

[1]基于高密度Bin图谱的大豆百粒重QTL定位和候选基因分析. 葛天丽,田宇,张皓,刘章雄,李英慧,邱丽娟. 2022

[2]大豆DMP基因的生物信息学及基因多样性分析. 周雅,张祥,赵权,孙建强,王晓波,邱丽娟. 2023

[3]斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析. 张世勇,钟立强,秦钦,王明华,潘建林. 2016

[4]中国荷斯坦牛IRAK2基因遗传多样性与乳腺炎的相关性研究. 孙淑霞,王长法,张连江,鞠志花,黄金明,李建斌,仲跻峰,张嘉保,李秋玲. 2011

[5]谷子热激蛋白HSP90基因家族鉴定及分析. 桑璐曼,汤沙,张仁梁,贾小平,刁现民. 2022

[6]谷子抽穗期基因SiGI的表达与单倍型变异分析. 姚琦,智慧,孟强,袁迪,张彬,刁现民,贾冠清. 2024

[7]基于EF-1α和β微管蛋白基因序列的棉花枯萎病菌遗传多样性和单倍型分析. 王海莹,陈小海,钟烨仪,龚举武,刘平,Chin Yaoxian,王沛政,袁有禄. 2023

[8]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009

[9]剂量率对辐照牛血清蛋白生化特性和结构的影响. 耿胜荣,鉏晓艳,李新,白婵,李海蓝,叶丽秀,廖涛. 2017

[10]垂穗披碱草MADS-box基因WM8克隆及分析. 张妙青,张吉宇,刘志鹏,王彦荣,张磊. 2012

[11]秘鲁鱿鱼肌原纤维蛋白凝胶的构效关系研究. 林伟伟,励建荣,潘伟春,傅玉颖,李昂. 2017

[12]昆虫嗅觉相关可溶性蛋白的研究进展. 张玉,杨斌,王桂荣. 2019

[13]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 2017

[14]山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析. 王梦雅,赵学亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡红莲,高民. 2018

[15]环糊精水解酶cds1-3底物通道氨基酸的定点突变研究. 汤宏赤,莫莉,闭海,林丽华,郭媛,庞浩. 2019

[16]改性处理对猪肌原纤维蛋白结构及凝胶特性的影响. 姜国川,王丽岩,刘亚春,孙洪蕊,张佳霖,刘学军,闫晓慧. 2019

[17]生长素反应因子ZmARF1的表达分析及互作网络探究. 孙建军,郭玉玺,王瑞,王德新,郭子宁,帖奇,鲁晓民. 2020

[18]小菜蛾腺苷受体基因PxAdoR克隆及杀虫靶标作用. 方鸣,柴一秋,陈官菊,章金明,吕要斌,黄勃. 2016

[19]桔黄赛多孢霉外泌弹性蛋白酶的生化特性. 彭元怀,葛歆,叶剑芝,金蓓,韩志萍. 2023

[20]牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测. 赵拴平,金海,徐磊,贾玉堂. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序