芝麻坏死花叶病毒(SNMV)部分cDNA合成及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 晏立英

作者： 晏立英;陈坤荣 ;韩成贵;张宗义;于嘉林;许泽永

作者机构：

关键词： 芝麻坏死花叶病毒;序列分析;外壳蛋白基因;同源性

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2002 年 24 卷 02 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 提取芝麻坏死花叶病毒RNA ,反转录合成cDNA ,对滞后重组质粒进行点杂交 ,得到阳性克隆并且测定序列。经计算机分析 ,获得 336 8个核苷酸 (nt)的序列。该序列含有一个完整的开放阅读框架 (ORF) ,该ORF由1134nt组成 ,推测编码 377个氨基酸 ,分子量为 4 0 .0 4 7× 10 3 道尔顿 (Da)。经比较它与Tombusviride科中Avreusvirus属石柑子潜隐病毒 (Pothoslatentvirus,PoLV)、Tombusvirus属病毒Cymbidiumringspotvirus(CRSV)外壳蛋白 (CP)氨基酸序列同源性分别为 4 0 .7%、4 0 .1% ,其起始氨基酸与Tombusvirus、Aureusvirus属另外的病毒CP起始氨基酸具有很高的保守性。根据这个完整ORF所编码蛋白的大小 ,与CRSV、PoLV病毒CP具一定的同源性 ,CP 5′端氨基酸的保守性 ,推测这个完整的ORF可能包含该病毒的外壳蛋白基因 ,并且这个病毒可能类似PoLV病毒 ,是Tombusviride科Aureusvirus属的一种新病毒

分类号： S432.41

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