基因加倍对棉花线粒体atpA基因RNA编辑率的影响
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张晓
作者: 张晓;李才华;王婧;张兰兰;牟晓雨;王昕玥;甘刘美;周鹏展;张锐
作者机构:
关键词: 棉花;线粒体基因组;atpA;基因加倍;RNA编辑
期刊名称: 生物技术进展
ISSN: 2095-2341
年卷期: 2022 年 12 卷 005 期
页码: 737-745
摘要: 植物线粒体基因组中存在RNA编辑(C-U)现象,且有完全编辑和部分编辑之分.棉花细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterile,CMS)系和保持系线粒体基因组中atpA基因各有两个拷贝,存在基因加倍现象,但atpA基因加倍对其RNA编辑率的影响尚不清楚.通过Southern blot、染色体步移技术确定出该基因每个拷贝具体的DNA序列,发现一个拷贝是完整的,一个拷贝是截短的.用RT-PCR、环化RT-PCR方法扩增出每个拷贝相应的cDNA,结果表明:棉花CMS系和保持系atpA基因完整拷贝和截短型拷贝都转录.完整拷贝、截短型拷贝中分别存在6、4个RNA编辑位点.完整拷贝6个RNA编辑位点在保持系中的编辑率都是100%;在CMS系中编辑率分别是100%、85%、100%、92%、100%、100%.截短型拷贝4个位点在保持系中的编辑率分别是55%、37%、55%、27%;在CMS系中编辑率分别是100%、90%、100%、100%.据此推测截短型拷贝在保持系中承受选择压较小,很可能已失去功能;而在CMS系中仍承受较大选择压,很可能具有新的功能.
分类号: S562
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