美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征

文献类型: 中文期刊

第一作者: 牟希东

作者: 牟希东;宋红梅;汪学杰;杨叶欣;罗渡;顾党恩;罗建仁;胡隐昌

作者机构:

关键词: 美丽硬仆骨舌鱼;mtDNA;D-loop;遗传变异

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2012 年 0 卷 09 期

页码: 185-190

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用直接测序法分析美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)3个种群(金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼)共24个个体的线粒体D-loop区的遗传变异特征。经序列比对、分析,金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼的D-loop序列不仅在个体间存在位点序列的变异(17个简约性信息位点),而且还存在序列长度的多态性(长度为915-924 bp),这种长度的差异在于存在不同碱基长度的微卫星序列。3种龙鱼碱基组成基本一致,G含量偏低。定义了10种单倍型,但金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间没有共享单倍型,单倍型多样度较高(0.667-1.00),核苷酸多样度较低(0.001 09-0.003 23)。AMOVA分析显示,变异主要来自地理区内不同群体间,个体间遗传距离为0-0.008 7,显示遗传变异仍处于种内水平。NJ、MP和Bayesian构建的分子系统树拓扑结构基本一致,但不能有效地反映金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间的亲缘关系。

分类号: Q75

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