木薯SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 严华兵

作者： 周慧文;单建伟;谢向誉

作者机构：

关键词： 木薯;SCoT-PCR反应体系;正交试验设计;引物筛选

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2016 年 47 卷 10 期

页码： 1648-1652

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】优化木薯SCoT-PCR反应体系并进行SCoT引物筛选,为木薯辅助育种提供技术支持。【方法】以木薯品种新选048为材料,利用正交试验设计对DNA模板量、Mg~(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶量等因素进行优化,确定木薯最佳SCoT-PCR反应体系,并用其进行SCoT引物筛选。【结果】木薯最佳SCoT-PCR反应体系(20.0μL):模板DNA 60 ng,引物浓度0.30μmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,Mg~(2+)1.50 mmol/L,dNTPs 0.25 mmol/L。利用该体系筛选出19条SCoT引物,能稳定扩增出数量多、清晰可辨且多态性丰富的条带。【结论】优化的木薯SCoT-PCR反应体系检测结果稳定,重复性好,且筛选出的19条引物均适用于木薯遗传多样性分析。

分类号： S533

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