生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族
文献类型: 中文期刊
第一作者: 朱宗文
作者: 朱宗文;张爱冬;吴雪霞;查丁石
作者机构:
关键词: 脂肪酸去饱和酶(FAD);茄子(Solanum melongena L.);基因家族
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 008 期
页码: 2453-2463
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 脂肪酸去饱和酶(FAD)广泛分布于生物体内,其主要功能是在脂肪酸的生物合成过程中,从碳链中去除氢,从而产生碳碳双键。利用拟南芥FAD家族基因和茄子基因组数据,对茄子基因中可能含有的FAD基因进行鉴定和生物信息学分析。共鉴定出茄子FAD基因家族成员38个,其中FAB亚家族成员5个。对家族成员进行蛋白理化性质分析、系统进化分析和保守结构域分析,发现各亚家族成员间具有较为相似的保守基因序列和蛋白特性;基因结构分析表明,FAD家族成员间存在着不同的基因结构,但聚为一类的亚家族基因具有进化的保守性;染色体定位显示茄子FAD家族成员主要分布在5号染色体、6号染色体和4号染色体上。亚细胞定位预测茄子FAD家族成员主要分布在内质网、叶绿体和质膜上,FAB亚家族则全部定位在叶绿体上。
分类号: S641.1
- 相关文献
[1]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021
[2]茄子品种'绿秀丽'青茄纯度鉴定的SSR标记筛选. 谭枫,朱宗文,刘晓慧,张爱冬,尚静,查丁石,吴雪霞. 2023
[3]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[4]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[5]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[6]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008
[7]拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析. 王凯. 2010
[8]蝴蝶兰NBS-LRR家族基因挖掘和生物信息学分析. 蒋卉,张晶,符真珠,董晓宇,王慧娟,李艳敏,高杰,王利民,张和臣. 2018
[9]陆地棉蔗糖磷酸合成酶基因家族的鉴定及表达分析. 晁毛妮,胡海燕,付丽娜,温青玉,胡根海,骆雨锋,李娅楠,王清连. 2020
[10]普通烟草PMEI家族的鉴定与表达分析. 韩林贺,丁安明,孔英珍. 2018
[11]植物β-半乳糖苷酶研究进展. 李军玲,闫双勇,张融雪,王晓静,孙玥,苏京平,孙林静. 2020
[12]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011
[13]大麦蛋白质二硫键异构酶基因家族的鉴定与表达分析. 时丽洁,蒋枞璁,王方梅,杨平,冯宗云. 2019
[14]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019
[15]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021
[16]植物β-葡萄糖苷酶的研究进展. 王晨,李家儒. 2021
[17]甘薯细胞壁蔗糖转化酶基因IbCWIN家族成员鉴定及表达分析. 宋天晓,刘意,饶莉萍,Soviguidi Deka Reine Judesse,朱国鹏,杨新笋. 2021
[18]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021
[19]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[20]油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析. 郭栋,张艳阳,杜媚,周宝元,高卓晗,赵明,袁卉馥. 2020
作者其他论文 更多>>
-
鲜切茄子褐变研究进展
作者:周亚茹;肖凯;张爱冬;谭枫;吴雪霞
关键词:茄子;鲜切;褐变
-
不同种植密度和整枝方式对甜椒植株生长和果实品质的影响
作者:朱宗文;刘凯歌;宋云鹏;李腊梅
关键词:甜椒;P16138组合;栽培密度;整枝方式;产量;品质
-
生菜LsMYB4基因在拟南芥中异位表达并提高其耐旱性的研究
作者:张丽丽;刘凯歌;朱宗文;李腊梅;宋云鹏
关键词:MYB;生菜;拟南芥;非生物胁迫;耐旱性
-
土壤修复菌剂对设施茄子生长及土壤理化性质的影响
作者:张爱冬;刘锦逵;肖凯;王圣洁;万继明;吴雪霞;查丁石
关键词:土壤修复菌剂;茄子;产量;品质;土壤理化性质
-
上海地区茄子长周期简约化栽培技术
作者:朱宗文;吴雪霞;查丁石;顾大国
关键词:茄子;长周期栽培;剪枝;上海地区
-
耐抽薹生菜新品种申选7号
作者:刘凯歌;张丽丽;朱宗文;宋云鹏
关键词:
-
茄子果实生长发育过程中果皮主要色素含量的变化及相关基因表达分析
作者:谭枫;肖凯;刘晓慧;黄倩茹;张爱冬;吴雪霞
关键词:茄子;果皮颜色;花青素;叶绿素;类胡萝卜素