新疆旱獭肠道RNA病毒的宏转录组学研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 颜广智

作者： 颜广智;孙悦;闫晓敏;陈俊杰;赵梓含;屈勇刚;涂长春;黄良宗;何彪

作者机构：

关键词： 新疆;旱獭属;宏转录组学;RNA病毒;进化分析

期刊名称： 军事医学

ISSN： 1674-9960

年卷期： 2022 年 46 卷 007 期

页码： 534-539

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 了解新疆地区旱獭(Marmota)肠道携带RNA病毒的病原本底.方法 采用宏转录组学方法对新疆喀什地区14只健康旱獭肠道样品进行病毒组分析.结果 基于重叠序列(contig)水平共注释到5个脊椎动物病毒科,分别为星状病毒科、小RNA病毒科、呼肠孤病毒科、圆环病毒科和腺病毒科.根据病毒宏转录组学结果,对注释到的病毒进行检测与进化分析,发现心病毒、嵴病毒、摩萨病毒与参考毒株同源性较高,为这些病毒变异株,而肠道病毒、腺病毒与已知病毒具有明显的遗传差异,可能为该病毒新种;星状病毒与其他旱獭源星状病毒之间氨基酸同源性差异较大,显示星状病毒在旱獭体内具有遗传多样性.值得注意的是,旱獭轮状病毒与牛轮状病毒核苷酸同源性高达92%,表明该病毒可能经过粪口途径实现跨种传播.结论 该研究揭示了旱獭肠道携带RNA病毒的多样性,为了解旱獭病毒本底、监测病毒传播生态链提供了重要数据.

分类号： S852.65

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