CAPS与熔解曲线技术相结合的菜薹SNP基因分型体系的建立与验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李平霞

作者： 李平霞;黄英金;刘博;梁建丽;程锋;武剑;王晓武

作者机构：

关键词： 菜薹;酶切扩增多态性序列;熔解曲线;单个核苷酸多态性;高通量基因分型

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 10 期

页码： 1916-1926

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据不同长度或不同碱基序列的DNA片段的熔解温度(Tm)不同的原理,将酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)与熔解曲线(melting curve,MC)技术相结合,建立了CAPS-MC技术,从而实现SNP分子标记基因分型。通过菜薹‘L58’和紫菜薹‘ZCT095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,预测了719个HindⅢ内切酶识别碱基序列的SNP位点,并将其设计成CAPS-MC分子标记,从中随机选择10对标记进行体系建立与优化,结果显示本体系有灵敏度强、精准性高、快速、高通量、经济实用等优势。

分类号： S634.5

  • 相关文献

[1]CAPS 与熔解曲线技术相结合的菜薹SNP 基因分型体系的建立与验证. 李平霞,黄英金,刘博,梁建丽,程锋,武剑,王晓武. 2013

[2]猪ZFAND6基因克隆、序列分析及其多态位点检测. 吴华莉,涂尾龙,曹建国,王洪洋,张莺莺,谈永松. 2020

[3]SNP分子标记及其在作物品种鉴定中的应用. 田海燕,张海娜,王永强,周永萍,张莹璐. 2024

[4]一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术. 林旻,杨绍华,林艳,王月,胡太蛟,宋亚娜,潘雷博,陈在杰. 2023

[5]液相芯片技术在动物遗传育种中的应用与发展. 丁文家,魏大为,杨尚,陈宁博,马云,雷初朝,黄永震. 2025

[6]一种新型鸭呼肠孤病毒SYBRGreenⅡ荧光定量PCR方法的建立. 丁明洋,戚伟强,陈宗艳,朱杰,吴巧梅,缪秋红,李传峰,吴润,刘光清. 2016

[7]SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立. 谭永贵,刘腾,朱杰,郭慧敏,吴巧梅,李琦,缪秋红,陈宗艳,李传峰,刘光清. 2017

[8]SYBR~ Green Ⅰ实时PCR检测转Cry1Ab/c基因水稻. 宋君,雷绍荣,刘勇. 2009

[9]一种新型鸭呼肠孤病毒SYBR GreenⅡ荧光定量PCR方法的建立. 丁明洋,戚伟强,陈宗艳,朱杰,吴巧梅,缪秋红,李传峰,吴润,刘光清. 2016

[10]SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测类猪圆环病毒因子P1. 温立斌,何孔旺,杨汉春,郭容利,周俊明,钟书霖. 2009

[11]一种新型鸭呼肠孤病毒SYBR Green II荧光定量PCR方法的建立. 丁明洋,戚伟强,陈宗艳,朱杰,吴巧梅,缪秋红,李传峰,吴润,刘光清. 2016

[12]植物SNP数据库及转化CAPS的方法. 闫双勇,刘小红,苏京平,马忠友,孙林静,卢百关. 2006

[13]通过分子标记辅助选择培育优良食味水稻新品种. 王才林,陈涛,张亚东,朱镇,赵凌,林静. 2009

[14]稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS标记的开发与验证. 王惠梅,陈洁,施勇烽,潘刚,沈海超,吴建利. 2012

[15]亚洲棉EST-SNP的挖掘及其在陆地棉中的验证. 徐鹏,蔡继鸿,郭琪,张香桂,徐珍珍,沈新莲. 2017

[16]利用分子标记辅助选择技术选育具有中等直链淀粉含量的早稻品种. 夏明元,李进波,张建华,万丙良,戚华雄. 2004

[17]柑橘CAPS标记和AS-PCR引物的开发. 雷天刚,何永睿,彭爱红,许兰珍,刘小丰,姚利晓,邹修平,江东,陈善春. 2012

[18]通过分子标记辅助选择培育优良食味水稻新品种南粳46(英文). 王才林,张亚东,朱镇,陈涛,赵凌,林静,周丽慧. 2009

[19]稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS标记的开发与验证(英文). 王惠梅,陈洁,施勇烽,潘刚,沈海超,吴建利. 2012

[20]秋季菜薹田间品比试验初报. 佘旭东,刘凤军,牟建梅,徐君,李军,宋英,张国芹,何玲珍. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序