猕猴桃LysM型类受体激酶基因家族生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 何蕾
作者: 何蕾;王文霞;胡容平;尹恒
作者机构:
关键词: 猕猴桃;LysM-类受体激酶;基因家族;生物信息学分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 010 期
页码: 3191-3198
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 植物Lys M型类受体激酶基因家族(lysin motif receptor-like kinase, LYKs)在植物自身免疫防御系统及与病原微生物协同进化中的重要作用已被证实,目前已成为研究植物基因功能的热点。本研究以生物信息学方法在猕猴桃全基因组范围内鉴定并命名Ac LysM基因家族成员,分析其家族成员染色体定位、蛋白基序、结构域和亚细胞定位,以及AcLysM基因家族成员的蛋白理化性质。共获得40个AcLysM基因家族成员,其蛋白分子量范围为10~126 kD、等电点在4.43~9.42之间,平均亲水系数介于-0.603~0.484。AcLysM基因家族成员分为三个亚类,亲缘关系较近的家族成员往往具有相同的motif和domain,甚至多个基序和结构域的排序都是相似的,推测该亚族成员在猕猴桃进化过程中执行相似的功能,在响应猕猴桃病菌侵染的过程中发挥重要的激发、传导和调控作用。本研究分析了猕猴桃LysM型类受体激酶基因家族,为后续深入研究LysM基因家族成员在猕猴桃抵御病虫害中的作用提供理论依据。
分类号: S663.4
- 相关文献
[1]猕猴桃蔗糖合酶基因家族鉴定及果实发育过程表达分析. 陈成,王依,杨勇,阎永齐. 2023
[2]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023
[3]绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析. 杨杨,余乾,刘昱成,杨华,赵卓,王立民,周平,杨庆勇,代蓉. 2024
[4]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020
[5]乌拉尔图小麦NBS-LRR家族生物信息学分析. 刘小芳,袁欣,聂迎彬,张晶. 2018
[6]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021
[7]香蕉高亲和性钾转运蛋白(HAK)家族全基因组鉴定及表达. 田娜,王斌,伍俊为,武欢,刘嘉鹏,刘范,邓贵明,黄玉吉,程春振. 2022
[8]基于苋菜转录组的TCP基因家族成员鉴定及表达分析. 安子贤,李宜轩,郑友峰,肖昉,王乐,陈何,赖钟雄,牟建梅,刘生财. 2022
[9]水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析. 谭炎宁,张超,殷小林,何强,肖应辉,邓华凤. 2019
[10]辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析. 刘冬梅,洪权春,陈文超,丁锦平,陈姝彤,徐园园,韩霜,朱晓琴,王亚月,裴冬丽. 2019
[11]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[12]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[13]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[14]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008
[15]拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析. 王凯. 2010
[16]蝴蝶兰NBS-LRR家族基因挖掘和生物信息学分析. 蒋卉,张晶,符真珠,董晓宇,王慧娟,李艳敏,高杰,王利民,张和臣. 2018
[17]陆地棉蔗糖磷酸合成酶基因家族的鉴定及表达分析. 晁毛妮,胡海燕,付丽娜,温青玉,胡根海,骆雨锋,李娅楠,王清连. 2020
[18]普通烟草PMEI家族的鉴定与表达分析. 韩林贺,丁安明,孔英珍. 2018
[19]植物β-半乳糖苷酶研究进展. 李军玲,闫双勇,张融雪,王晓静,孙玥,苏京平,孙林静. 2020
[20]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011
作者其他论文 更多>>
-
花椒病虫害绿色防控技术研究进展
作者:朱建义;胡容平;徐湘婷;范中菡;陈松;陈庆华
关键词:花椒(Zanthoxylum;bungeanum;Maxim.);病虫害;绿色防控技术
-
腐殖酸对桃幼苗生长及养分吸收的影响
作者:范严心;代京桐;徐杨;胡容平;陈松;陈庆华;林立金;范中菡
关键词:腐殖酸;桃幼苗;生长;养分吸收
-
胺鲜酯对树番茄幼苗养分吸收和生理指标的影响
作者:张雪梅;王雨熙;朱沿舟;肖云英;林立金;胡容平
关键词:树番茄;胺鲜酯;养分吸收;生理指标
-
氨基酸水溶肥对毛桃幼苗氮、磷和钾吸收的影响
作者:范中菡;肖云英;庞攀;廖慧苹;陈庆华;陈松;林立金;胡容平
关键词:氨基酸水溶肥;毛桃幼苗;养分吸收
-
氨基酸水溶肥促进桃苗生长
作者:范中菡;彭雪梅;庞攀;廖慧苹;陈庆华;陈松;林立金;胡容平
关键词:桃(Prunus persica L.);实生苗;氨基酸;水溶肥;生长
-
壳聚糖对桃果实品质的影响
作者:范中菡;彭雪梅;李睿;陈庆华;陈松;林立金;胡容平
关键词:桃;壳聚糖;浓度;果实品质
-
氨基酸水溶肥对桃果实品质的影响
作者:范中菡;张雪梅;陈庆华;陈松;林立金;胡容平
关键词:桃;氨基酸;果实品质