微生物组分析方法与功能挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高云云

作者： 高云云;杨海飞;吕虎杰;刘永鑫

作者机构：

关键词： 微生物组;宏基因组;扩增子;分析方法;功能挖掘

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 40 卷 010 期

页码： 98-107

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微生物是生命科学研究中不可或缺的重要资源,其研究对推动科学进步、促进人类健康和改善环境质量等具有重要意义.随着二、三代高通量测序技术的迅猛发展,我们对微生物世界的认知得到了极大提升,在面对大量的微生物组数据时,选择适当的分析方法以实现快速、准确的信息挖掘显得尤为关键.本文对近年来微生物组研究的进展进行了系统的回顾与分析,着重更新了扩增子、培养组和宏基因组等二代短读序宏基因组数据的分析工具,纳入了三代长读序宏基因数据的处理方案,并提出了标准化数据分析流程的必要性.此外,本文结合解析微生物组的实例案例,侧重介绍其在植物与根系微生物互作、微生物多样性等方面的应用实例,探讨了不同方法在微生物组构成、结构和功能分析中的优劣,展示了宏基因组数据挖掘在应用方面的潜力,以期拓宽宏基因组数据挖掘的研究思路.最后,本文指出了当前微生物组研究中的不足和面临的挑战,并展望了未来微生物组研究技术的标准化与流程化方面的发展趋势,以期加速微生物组的功能与应用的研究进程.

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