弧菌科质粒pJV的全序列测定、基因预测及其复制区的鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜娜

作者： 姜娜;邢薇;李铁梁;罗琳;闫兵兵

作者机构：

关键词： 鳗弧菌;质粒;测序;基因预测;复制区

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2016 年 23 期

页码： 18-21+296

收录情况： 北大核心

摘要： 为了从条件致病菌鳗弧菌中提取到天然质粒,获得该质粒的全序列,并得到在弧菌中起复制作用的区域,试验采用向上引物和向下引物共9条,双向测通该质粒,经拼接得到质粒p JV的全序列,利用Glimmer3基因预测软件对该质粒可能包含基因模型进行预测和基因注释,通过在线工具OriFinder预测分析该质粒的复制区域,并将该区域克隆到T载体中,验证重组质粒在弧菌科菌种中的复制效果。结果表明:该质粒p JV全长5 982 bp(Gen Bank登录号为JQ782192),有4个含有核糖体结合位点的基因(UQY-2、UQY-3、UQY-4、UQY-6);质粒p JV的复制元件是一段长313 bp的序列(含Dna A boxes)。说明经过试验验证,该片段使T载体具有在维氏气单胞菌中复制的能力,即证明该片段为鳗弧菌质粒p JV的复制区,可用于新弧菌科载体的构建和疫苗研制等。

分类号： S941.4

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