CAPS 与熔解曲线技术相结合的菜薹SNP 基因分型体系的建立与验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李平霞

作者： 李平霞;黄英金;刘博;梁建丽;程锋;武剑;王晓武

作者机构：

关键词： 菜薹;酶切扩增多态性序列;熔解曲线;单个核苷酸多态性;高通量基因分型

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 10 期

页码： 1916-1927

收录情况： CSCD

摘要： 根据不同长度或不同碱基序列的DNA 片段的熔解温度(T_m)不同的原理,将酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)与熔解曲线(melting curve,MC)技术相结合,建立了CAPS-MC 技术,从而实现SNP 分子标记基因分型。通过菜薹‘L58’和紫菜薹‘ZCT095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,预测了719个HindⅢ内切酶识别碱基序列的SNP 位点,并将其设计成CAPS-MC 分子标记,从中随机选择10对标记进行体系建立与优化,结果显示本体系有灵敏度强、精准性高、快速、高通量、经济实用等优势。

分类号：

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