西瓜KASP标记的开发及指纹图谱的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张跃星

作者： 张跃星;张瑞青;肖玉珍;代雪;张勇;王中元;于蓉;侯尹婕;张显;魏春华

作者机构：

关键词： 西瓜;KASP;指纹图谱;分子标记

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2025 年 008 期

页码： 54-64

收录情况： 北大核心

摘要： 开发适用于西瓜种质基因分型的KASP(kompetitive allele specific PCR)标记,并构建种质指纹图谱,对促进西瓜种质资源的保护、品种鉴定和遗传改良具有重要的科学意义.根据西瓜重测序数据分析鉴定的高质量核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,共设计50个KASP标记,并在43份西瓜材料中进行基因分型,进一步通过聚类分析和指纹图谱构建,评估其遗传多样性.结果表明:KASP标记设计的成功率为40.0%,但不同染色体上KASP标记成功率有所差异,其中1号和7号染色体的成功率最高,达到75.0%;挑选16个最优KASP标记,根据其在43份西瓜材料中的基因分型结果构建指纹图谱,将其转化为二维码,便于快速识别和查询西瓜材料遗传信息;对43份材料进行聚类分析,发现饲用西瓜大都形成了一个独立的分支,且遗传距离相近,而黏籽西瓜和栽培西瓜则在多个分支中分布,遗传距离相对较远,充分显示出它们之间遗传的多样性和复杂性.试验成功开发并应用西瓜KASP标记技术,为西瓜遗传研究与种质资源评价提供了新的工具和方法,也为西瓜的品种鉴定和种质资源管理提供了科学依据.

分类号： S651

  • 相关文献

[1]甜瓜KASP标记开发及指纹图谱构建. 肖玉珍,张瑞青,张跃星,代雪,张勇,王中元,于蓉,侯尹婕,张显,魏春华. 2024

[2]大豆PRR家族基因KASP标记的开发. 王培国,张君权,贾鸿昌,孙石,王立伟,白江平,韩天富. 2023

[3]黄淮南部小麦重要性状功能基因的KASP标记检测与分析. 董海滨,王永霞,方宇辉,赵明忠,高崇,齐学礼,彭超军. 2025

[4]芸薹属蔬菜分子标记数据库VEGMarkerDB的开发与应用. 杨宝菊,贺小宁,陈海旭,蔡旭,侯佳伟,李玉芳,王辉,王晓武,武剑. 2025

[5]西瓜种质资源鉴定评价及其DNA指纹图谱构建. 李超汉,宋荣浩,杨红娟,朱丽华,顾卫红. 2021

[6]西瓜新品种‘抗病948’和‘申抗988’杂交种纯度及其遗传特异性的SSR标记鉴定. 李超汉,刘莉,刘翔,朱丽华,宋荣浩. 2015

[7]西瓜DUS测试标准品种SSR指纹图谱构建及应用. 范建光,张海英,宫国义,肖菁,郭绍贵,任毅,张洁,王秀峰,马艳明. 2013

[8]西瓜核心种质的AFLP指纹图谱和SCAR标记(英文). 车克鹏,许勇,梁春阳,宫国义,翁曼丽,张海英,金德敏,王斌. 2003

[9]基于SSR标记的5个西瓜新品种纯度鉴定及特异性分析的研究. 李超汉,刘莉,刘翔,朱丽华,宋荣浩,杨红娟,顾卫红. 2015

[10]利用SSR分子标记构建‘太湖糯’、‘苏御糯’及部分优质糯稻的DNA指纹图谱. 陈培峰,黄健,朱勇良,乔中英,黄萌,王建平. 2014

[11]利用SSR构建甜菜品种的分子身份证. 栗媛,王茂芊,邳植,吴则东. 2019

[12]38个欧美草莓栽培品种SSR指纹图谱的构建. 王壮伟,赵密珍,袁骥,吴伟民,钱亚明. 2011

[13]杨树分子标记研究进展. 张德强,张志毅,杨凯. 2000

[14]甜樱桃品种SSR指纹图谱数据库的建立. 艾呈祥,张力思,魏海蓉,苑克俊,金松南,刘庆忠. 2007

[15]花生分子标记的研究进展. 任小平,姜慧芳,廖伯寿,陈本银. 2006

[16]花生分子标记的研究进展. 苏君伟,于树涛,史普想,于洪波,赵艳. 2011

[17]DNA指纹图谱在玉米杂交种真伪及纯度鉴定中的应用. 朱卫红,齐建双,铁双贵,卢彩霞,孙建军,李艺,周柯. 2007

[18]基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建. 王贵,李蕊蕊,吴茂宏,任菲宏,王丽丽,乔光. 2023

[19]苋菜主要品种DNA指纹图谱构建与遗传多样性分析. 王燕,徐坚,陈先知,徐志豪. 2012

[20]AFLP技术在林木遗传改良中的应用. 张德强,张志毅,杨凯. 2000

作者其他论文 更多>>

微信小程序