藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 时丕彪

作者： 时丕彪;何冰;费月跃;王军;王伟义;魏福友;吕远大;顾闽峰

作者机构：

关键词： 藜麦;GRF转录因子;进化分析;表达分析

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2019 年 45 卷 012 期

页码： 1841-1850

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长调控因子(growth-regulating factor,GRF)是植物特有的一类转录因子,对植物的生长发育起重要的调控作用.藜麦是一种单体植物即可满足人体基本营养需求的食物,也是未来最具潜力的农作物之一.但是关于藜麦GRF基因家族的研究至今尚缺乏报道.因此,本研究利用生物信息学方法,对藜麦GRF基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统发育关系及组织表达进行分析.结果表明,藜麦中共有18个GRF转录因子,蛋白长度77~621 aa,分子量8.81~67.38 kD,等电点5.23~9.37;每个成员含有1~4个内含子及2~5个外显子,这些GRF蛋白都具有由31~35个氨基酸组成的QLQ保守结构域或由25~43个氨基酸组成的WRC保守结构域.系统进化分析表明,藜麦与拟南芥的GRF转录因子亲缘关系比水稻更近.表达图谱显示,藜麦GRF基因具有明显的组织表达特异性,总体在种子中的表达量较高,其次是在花序和根中,在其他组织中的表达量相对较低.

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