基于重测序数据的昌都黑山羊遗传多样性及群体结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 阿旺措吉

作者： 阿旺措吉;仁青措姆;黄舒泓;周先辉;德吉;索朗达;王小龙;吴玉江;巴贵

作者机构：

关键词： 藏山羊;遗传多样性;全基因组重测序;群体结构

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN：

年卷期： 2022 年 010 期

页码： 30-35

收录情况： 北大核心

摘要： 藏山羊是中国独特的地方品种。为进一步从基因组水平上了解藏山羊的遗传多样性及群体遗传结构，该研究对西藏昌都黑山羊的3个不同地方群体进行了全基因组重测序。鉴定3个采样群体的SNP位点结果表明，共鉴定出13 426 331个SNP位点；遗传多样性及连锁不平衡分析结果显示，3个采样群体的核苷酸多样性相近，并且LD衰减曲线相似；通过NJ进化树分析，其拓扑结构显示3个采样群体聚成1支，与西藏地区其它8个山羊品种或群体显著分离；群体结构分析结果显示，采样群体间亚群组成较为一致，但有2个采样群体存在一定的杂交特征；主成分分析显示，3个采样群体与其他西藏山羊品种或群体在前2个主成分上分离，位置及相互关系符合进化树结构以及群体结构结果。该研究从基因组水平解释了昌都黑山羊的种质特性，也为后续藏山羊种质资源保护和利用、重要经济性状的基因定位以及分子育种提供重要的理论依据。

分类号： S827

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