基于高通量转录组测序和网络药理学方法筛选抗高尿酸血症燕麦活性肽
文献类型: 中文期刊
第一作者: 冯思婷
作者: 冯思婷;刘佩;张译鹤;武贤婧;任书强;高飞
作者机构: 青岛农业大学生命科学学院;中国农业科学院深圳农业基因组研究所
关键词: 燕麦活性肽;转录组分析;高通量虚拟酶解;网络药理学;高尿酸血症
期刊名称: 食品工业科技
ISSN: 1002-0306
年卷期: 2024 年 015 期
页码: 10-24
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从组学出发为挖掘和筛选抗高尿酸血症燕麦活性肽,并研究燕麦活性肽在抗高尿酸血症上的作用机制。本研究以燕麦籽粒为原料提取RNA,用于高通量转录组测序,通过与参考基因组比对和蛋白编码基因表达量定量以获取燕麦籽粒蛋白序列,利用高通量虚拟酶解、Peptide Ranker和ADME/T筛选燕麦活性肽成分,借助网络药理学技术挖掘燕麦蛋白源抗高尿酸血症活性多肽。结果表明,‘坝莜1号’和‘白燕7号’燕麦籽粒在籽粒形成期和灌浆期所表达重复性低于90%的蛋白序列数分别为6310、3157和5804、5107条。其中最优肽文库为在灌浆期裸燕麦‘坝莜1号’的蛋白序列经蛋白酶K模拟酶解产生的肽文库,在该条件获得的肽文库中预测筛选出42条具有潜在活性和良好成药性的燕麦活性肽。初步筛选主要抗高尿酸血症燕麦活性肽序列为PPF、PPPL、MPF、MPL和PPPF,可能通过靶向ALB、IL1B、SRC、CASP3和STAT3等基因,作用于癌症、脂质与动脉粥样硬化和化学致癌-受体激活等信号通路干预高尿酸血症。分子对接验证显示结合能小于-5 kJ/mol占整体82.86%,表示燕麦多肽主要活性成分与大部分靶点结合活性较好。此外,最优燕麦合成多肽PPF表现出良好的黄嘌呤氧化酶抑制效果(IC50=6.132 mmol/L)。裸燕麦蛋白可作为酶解释放抗高尿酸血症活性肽的良好前体,同时为燕麦蛋白酶解生产生物活性肽和利用燕麦活性肽开发抗高尿酸血症功能性食品提供理论参考。
分类号: TS201.2%R589.7
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