高通量测序解析烟草苗床期基质细菌和真菌群落结构与多样性变化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗飞

作者： 罗飞;李文红;刘亭亭;汪汉成;孙美丽;蔡刘体;穆青;余知和

作者机构：

关键词： 苗床期;育苗基质;Illumina MiSeq高通量测序;群落结构;烟苗;微生物多样性

期刊名称： 中国烟草学报

ISSN： 1004-5708

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 79-88

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【背景和目的】烟苗的生长发育状况与育苗基质微生物密切相关，为了解烟苗育苗阶段基质细菌和真菌群落结构与多样性特征。【方法】采用IlluminaMiSeq高通量测序对育苗基质中细菌和真菌群落进行测序与分析。【结果】不同育苗阶段基质（播种后第10～66 d）真菌和细菌在菌群结构及相对丰度均存在差异。基质中优势细菌门均为变形菌门Proteobacteria（65.60%～72.80%）、拟杆菌门Bacteroidetes（16.75%～21.35%）和酸杆菌门Acidobacteria（1.38%～4.67%）；优势细菌属均为德沃斯氏菌属Devosia（4.81%～14.20%）、罗河杆菌属Rhodanobacter（1.60%～6.19%）、戴氏菌属Dyella（0.38%～8.92%）等，其中，德沃斯氏菌属和罗河杆菌属在播种第66 d的相对丰度较第10 d分别降低8.6%和3.31%。播种第38 d基质细菌Shannon多样性指数和ACE丰富度指数最低，分别为7.25和1161.10；播种第24 d和66 d基质细菌Shannon多样性指数最高，分别为8.15和8.01。基质中优势真菌门均为子囊菌门Ascomycota（16.84%～23.55%）、担子菌门Basidiomycota（4.93%～11.95%）和Aphelidiomycota（0.04%～5.32%）；优势真菌属均为假裸囊菌属Pseudogymnoascus（0.42%～11.63%）、节丛孢属Arthrobotrys（0.28%～14.29%）、革菌属Tomentella（0.21%～8.96%）等，其中，节丛孢属和革菌属在播种第52 d的相对丰度较第10 d分别提高14.01%和8.57%。播种第24 d基质真菌Shannon多样性指数最低，为3.93；播种第10 d和52 d基质真菌Shannon多样性指数最高，分别为5.57和5.86。功能预测显示，播种66 d内烟苗基质细菌主要功能分布在代谢类、遗传信息处理类和环境信息处理类等；真菌主要功能分布在腐生类和外生菌根类。【结论】烟草苗床期基质细菌和真菌群落种类无显著变化，但其相对丰度与多样性指数在不同育苗阶段存在差异。

分类号： S572

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